pseudouridylate synthase 1

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同義遺伝子名

PUS1, MLASA, tRNA-uridine isomerase I, tRNA pseudouridine synthase A, pseudouridylate synthase 1, MGC11268, PP8985, tRNA pseudouridylate synthase I

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:15.40 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:47 動脈:- 静脈:- リンパ節:60.70 末梢血:72.90 脾臓:37.80 胸腺:25.80 骨髄:- 脂肪:80.70 骨:12.80 皮膚:-
GeneChip 大脳:5.41 小脳:5.36 脳幹:5.22 脳梁:5.48 松果体:- 末梢神経:5.21 脊柱:5.14 網膜:- 目:- 動脈:5.82 静脈:5.65 リンパ節:6.50 末梢血:- 脾臓:6.36 胸腺:6.24 骨髄:5.97 脂肪:5.61 骨:- 皮膚:6.22
CAGE 大脳:2.73 小脳:- 脳幹:2.43 脳梁:2.41 松果体:2.57 末梢神経:- 脊柱:2.22 網膜:- 目:- 動脈:2.46 静脈:2.83 リンパ節:2.81 末梢血:- 脾臓:2.81 胸腺:2.42 骨髄:- 脂肪:2.34 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:18.20 前立腺:11.30 卵巣:37.30 精巣:17.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:64.80 結腸:33.90     肝臓:31.70        肺:19.60    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:26.70 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.69 胎盤:5.11 前立腺:5.68 卵巣:5.99 精巣:6.02 心臓:5.41 骨格筋:5.49 食道:6.20 胃:5.91 腸:5.69 結腸:5.99 肝臓:5.99 肺:5.65 膀胱:- 腎臓:5.65 下垂体:5.23 甲状腺:5.75 副腎:6.13 膵臓:5.66 乳腺:6.10 唾液腺:5.46
CAGE 子宮:2.31 胎盤:1.99 前立腺:2.35 卵巣:2.43 精巣:2.40 心臓:2.38 骨格筋:2.13 食道:2.46 胃:- 腸:2.46 結腸:2.79     肝臓:3.01    肺:2.41 膀胱:2.12 腎臓:2.46 下垂体:2.16 甲状腺:2.23 副腎:- 膵臓:2.98 乳腺:2.59 唾液腺:2.01
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.00 精巣:0.00 心臓:0.22 骨格筋:0.74 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.24     肝臓:1.33        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:0.61 唾液腺:-

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IDs

Refseq ID NM_001002020
Gene ID 80324
Unigene ID Hs.592004
Probe set ID 218670_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000177192
GTEx ID ENSG00000177192

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]  NM_001025561, NM_001025562, NM_019700
ラット[1]  NM_001025563, NM_001025562, NM_019700

染色体

12q24.33  [132,413,745  -  132,428,406]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001406  Pseudouridine synthase I, TruA
IPR020103  Pseudouridine synthase, catalytic domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10094309
12477932
15108122
15489334
15498874
15772074
16712791
16964243
17056637
17081983
18648068
19471022
19731322
20186120
20843780
21139048
22102571
22863883
22939629
22990118
22998747
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0008033  tRNA processing
GO:0031119  tRNA pseudouridine synthesis

Cellular Component

GO:0005739  mitochondrion
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0005667  transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0030374  ligand-dependent nuclear receptor transcription coactivator activity
GO:0009982  pseudouridine synthase activity
GO:0004730  pseudouridylate synthase activity
GO:0003723  RNA binding