jumonji C domain containing histone demethylase 1 homolog D (S. cerevisiae)

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

KIAA1718 protein, KIAA1718

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:21.30 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:122.70 脊柱:- 網膜:- 目:41.10 動脈:- 静脈:- リンパ節:30.30 末梢血:54.70 脾臓:56.70 胸腺:77.30 骨髄:59 脂肪:40.30 骨:38.40 皮膚:48
GeneChip 大脳:5.81 小脳:6.78 脳幹:5.78 脳梁:6.10 松果体:- 末梢神経:6.18 脊柱:6.15 網膜:- 目:- 動脈:6.15 静脈:6.52 リンパ節:6.87 末梢血:- 脾臓:6.93 胸腺:6.59 骨髄:7.85 脂肪:6.44 骨:- 皮膚:7.08
CAGE 大脳:2.56 小脳:- 脳幹:2.74 脳梁:2.54 松果体:2.93 末梢神経:- 脊柱:2.65 網膜:- 目:- 動脈:3.31 静脈:3.18 リンパ節:3.26 末梢血:- 脾臓:2.70 胸腺:2.99 骨髄:- 脂肪:3.76 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.67 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.62 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.15 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:47.40 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:56.20 心臓:38.30 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:32.40 結腸:84.80     肝臓:21.10        肺:44    膀胱:125.60 腎臓:52 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:80 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.76 胎盤:7.51 前立腺:6.13 卵巣:6.30 精巣:6.76 心臓:6.40 骨格筋:6.82 食道:6.62 胃:6.41 腸:6.34 結腸:5.87 肝臓:6.22 肺:7.01 膀胱:- 腎臓:5.52 下垂体:5.47 甲状腺:5.85 副腎:5.26 膵臓:5.17 乳腺:6.94 唾液腺:5.87
CAGE 子宮:2.96 胎盤:3.46 前立腺:2.85 卵巣:2.59 精巣:2.69 心臓:2.94 骨格筋:3.76 食道:3.22 胃:- 腸:3.58 結腸:3.47     肝臓:2.54    肺:3.38 膀胱:3.38 腎臓:2.18 下垂体:2.20 甲状腺:2.41 副腎:- 膵臓:2.48 乳腺:3.33 唾液腺:2.06
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.69 卵巣:1.73 精巣:2.76 心臓:1.95 骨格筋:4.45 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.69     肝臓:1.84        肺:2.95    膀胱:- 腎臓:1.89 下垂体:- 甲状腺:2.52 副腎:2.40 膵臓:- 乳腺:2.49 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_030647
Gene ID 80853
Unigene ID Hs.308710
Probe set ID 221778_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000006459
GTEx ID ENSG00000006459

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001033430
ラット[1]  NM_001033430

染色体

7q34  [139,784,546  -  139,876,835]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787  Zinc finger, PHD-finger
IPR001965  Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11214970
12477932
14702039
18029348
18187620
20023638
20084082
22143793
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0070544  histone H3-K36 demethylation
GO:0033169  histone H3-K9 demethylation
GO:0030901  midbrain development
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0051864  histone demethylase activity (H3-K36 specific)
GO:0032454  histone demethylase activity (H3-K9 specific)
GO:0005506  iron ion binding
GO:0035064  methylated histone residue binding
GO:0016706  oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0008270  zinc ion binding