high mobility group AT-hook 2

同義遺伝子名

High mobility group protein HMGI-C, HMGI-C, HMGA2, High mobility group AT-hook protein 2, HMGIC, LIPO, high mobility group AT-hook 2, BABL

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:9.50

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:-

目:11.80

動脈:30

静脈:66.60

リンパ節:10.10

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:177.60

GeneChip

大脳:3.88

小脳:3.89

脳幹:3.88

脳梁:3.91

松果体:-

末梢神経:4.04

脊柱:3.98

網膜:-

目:-

動脈:4.01

静脈:4.02

リンパ節:3.76

末梢血:-

脾臓:3.86

胸腺:3.71

骨髄:4.20

脂肪:3.78

骨:-

皮膚:3.82

CAGE

大脳:0.13

小脳:-

脳幹:0.17

脳梁:0.29

松果体:0.36

末梢神経:-

脊柱:0.74

網膜:-

目:-

動脈:1.03

静脈:0

リンパ節:0.06

末梢血:-

脾臓:0.45

胸腺:0.46

骨髄:-

脂肪:1.71

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.03

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.05

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.18

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:18.20

前立腺:11.30

卵巣:111.80

精巣:13

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:42.40

肝臓:-

肺:4.90

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:8.90

乳腺:27.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.99

胎盤:3.99

前立腺:3.58

卵巣:4

精巣:4.18

心臓:3.80

骨格筋:3.98

食道:3.65

胃:4

腸:4.01

結腸:4.52

肝臓:3.84

肺:3.70

膀胱:-

腎臓:3.69

下垂体:4.12

甲状腺:3.81

副腎:3.83

膵臓:3.97

乳腺:3.74

唾液腺:3.79

CAGE

子宮:1.03

胎盤:0.24

前立腺:0.15

卵巣:0.92

精巣:2.49

心臓:0.21

骨格筋:0.21

食道:0.26

胃:-

腸:1.43

結腸:2.32

肝臓:0

肺:0.50

膀胱:0.46

腎臓:0.39

下垂体:1.09

甲状腺:0.53

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0.90

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.05

卵巣:0.36

精巣:0.56

心臓:0.00

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.43

肝臓:0

肺:0.20

膀胱:-

腎臓:0.10

下垂体:-

甲状腺:0.12

副腎:0.04

膵臓:-

乳腺:0.00

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003483
Gene ID	8091
Unigene ID	Hs.505924
Probe set ID	208025_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000149948
GTEx ID	ENSG00000149948

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_010441
ラット [0]

染色体

12q14.3 [66,217,911 - 66,360,075]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020478	A.T hook-like
IPR017956	AT hook, DNA-binding motif
IPR000116	High mobility group, HMG-I/HMG-Y

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0030325	adrenal gland development
GO:0006284	base-excision repair
GO:0051301	cell division
GO:0021846	cell proliferation in forebrain
GO:0002062	chondrocyte differentiation
GO:0006325	chromatin organization
GO:0031052	chromosome breakage
GO:0030261	chromosome condensation
GO:0042769	DNA damage response, detection of DNA damage
GO:0001837	epithelial to mesenchymal transition
GO:0045444	fat cell differentiation
GO:0060613	fat pad development
GO:0031507	heterochromatin formation
GO:0008584	male gonad development
GO:0048762	mesenchymal cell differentiation
GO:0048333	mesodermal cell differentiation
GO:0003131	mesodermal-endodermal cell signaling
GO:0007067	mitosis
GO:0007095	mitotic cell cycle G2/M transition DNA damage checkpoint
GO:0007275	multicellular organismal development
GO:0043922	negative regulation by host of viral transcription
GO:0043066	negative regulation of apoptosis
GO:0048712	negative regulation of astrocyte differentiation
GO:0043392	negative regulation of DNA binding
GO:0045869	negative regulation of retroviral genome replication
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0021983	pituitary gland development
GO:0043065	positive regulation of apoptosis
GO:0071158	positive regulation of cell cycle arrest
GO:0010628	positive regulation of gene expression
GO:0040018	positive regulation of multicellular organism growth
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0010564	regulation of cell cycle process
GO:0060123	regulation of growth hormone secretion
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0009615	response to virus
GO:0035019	somatic stem cell maintenance
GO:0007283	spermatogenesis
GO:0048863	stem cell differentiation

Cellular Component

GO:0000228	nuclear chromosome
GO:0005634	nucleus
GO:0032993	protein-DNA complex
GO:0071141	SMAD protein complex

Molecular Function

GO:0051575	5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity
GO:0003680	AT DNA binding
GO:0070742	C2H2 zinc finger domain binding
GO:0008301	DNA bending activity
GO:0003677	DNA binding
GO:0003906	DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase activity
GO:0004677	DNA-dependent protein kinase activity
GO:0031492	nucleosomal DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0046332	SMAD binding
GO:0008134	transcription factor binding

high mobility group AT-hook 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function