collectin sub-family member 12

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

CL-P1, SRCL, SCARA4, COLEC12, collectin sub-family member 12, NSR2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:11.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:398.70 脊柱:- 網膜:- 目:70.50 動脈:30 静脈:- リンパ節:- 末梢血:18.20 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:80.70 骨:25.60 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:5.84 小脳:5.65 脳幹:6.17 脳梁:6.57 松果体:- 末梢神経:7.07 脊柱:6.25 網膜:- 目:- 動脈:6.77 静脈:6.78 リンパ節:5.97 末梢血:- 脾臓:3.57 胸腺:4.89 骨髄:4.66 脂肪:7.24 骨:- 皮膚:6.22
CAGE 大脳:2.56 小脳:- 脳幹:2.58 脳梁:3.16 松果体:2.83 末梢神経:- 脊柱:2.92 網膜:- 目:- 動脈:3.42 静脈:3.26 リンパ節:3.10 末梢血:- 脾臓:1.46 胸腺:1.47 骨髄:- 脂肪:3.71 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.89 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.64 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.55 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:138.40 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:51.10 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:33.90     肝臓:-        肺:58.70    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.27 胎盤:8.88 前立腺:7.23 卵巣:6.06 精巣:4.71 心臓:6.97 骨格筋:5.30 食道:5.91 胃:6.21 腸:6.34 結腸:6.10 肝臓:4.22 肺:7.32 膀胱:- 腎臓:4.88 下垂体:4.42 甲状腺:6.06 副腎:4.87 膵臓:5.04 乳腺:6.31 唾液腺:4.92
CAGE 子宮:4.01 胎盤:4.36 前立腺:3.40 卵巣:3.06 精巣:2.67 心臓:3.59 骨格筋:2.49 食道:3.16 胃:- 腸:2.68 結腸:2.97     肝臓:0.26    肺:3.71 膀胱:3.75 腎臓:2.13 下垂体:1.02 甲状腺:2.59 副腎:- 膵臓:1.87 乳腺:2.99 唾液腺:1.49
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.66 卵巣:2.75 精巣:4.00 心臓:2.95 骨格筋:1.54 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.28     肝臓:0.30        肺:4.78    膀胱:- 腎臓:2.15 下垂体:- 甲状腺:3.19 副腎:3.56 膵臓:- 乳腺:3.54 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_130386
Gene ID 81035
Unigene ID Hs.464422
Probe set ID 221019_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000158270
GTEx ID ENSG00000158270

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_130449
ラット [0]  

染色体

18p11.32  [319,355  -  500,729]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001304  C-type lectin
IPR016187  C-type lectin fold
IPR016186  C-type lectin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11162630
11564734
12477932
12601552
12761161
15845541
17043677
18423602
19073604
20034698
20237496
20351715
20379614
21561871
21832049
23251661
23333304

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0009756  carbohydrate mediated signaling
GO:0006952  defense response
GO:0045087  innate immune response
GO:0002221  pattern recognition receptor signaling pathway
GO:0006910  phagocytosis, recognition
GO:0051260  protein homooligomerization

Cellular Component

GO:0005581  collagen
GO:0030666  endocytic vesicle membrane
GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005534  galactose binding
GO:0030169  low-density lipoprotein binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0008329  pattern recognition receptor activity
GO:0005044  scavenger receptor activity