collagen, type XXI, alpha 1

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同義遺伝子名

DKFZp564B052, collagen, type XXI, alpha 1, COLA1L, MGC26619, FP633, dJ682J15.1, FLJ39125, dJ708F5.1, FLJ44623, COL21A1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:21.30 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:118.60 目:47 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:80.70 骨:12.80 皮膚:24
GeneChip 大脳:4.45 小脳:4.74 脳幹:4.73 脳梁:5.38 松果体:- 末梢神経:6.39 脊柱:5.06 網膜:- 目:- 動脈:7.53 静脈:5.75 リンパ節:4.17 末梢血:- 脾臓:3.74 胸腺:4 骨髄:4.06 脂肪:4.75 骨:- 皮膚:5.38
CAGE 大脳:1.96 小脳:- 脳幹:2.36 脳梁:2.49 松果体:1.81 末梢神経:- 脊柱:2.71 網膜:- 目:- 動脈:4.70 静脈:2.18 リンパ節:0.67 末梢血:- 脾臓:0.17 胸腺:0.33 骨髄:- 脂肪:1.25 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.18 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.06 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.47 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:72.90 胎盤:51 前立腺:- 卵巣:- 精巣:21.60 心臓:229.90 骨格筋:60.30 食道:- 胃:21.20 腸:- 結腸:8.50     肝臓:-        肺:44    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.08 胎盤:6.66 前立腺:5.65 卵巣:5.43 精巣:4.90 心臓:6.73 骨格筋:5.15 食道:4.51 胃:4.83 腸:4.56 結腸:4.25 肝臓:4 肺:5.82 膀胱:- 腎臓:3.72 下垂体:4.96 甲状腺:4.39 副腎:4.14 膵臓:3.94 乳腺:4.71 唾液腺:5.41
CAGE 子宮:3.92 胎盤:2.92 前立腺:2.54 卵巣:1.89 精巣:1.74 心臓:3.12 骨格筋:1.42 食道:2.10 胃:- 腸:1.52 結腸:2.00     肝臓:0.46    肺:2.63 膀胱:2.93 腎臓:1.09 下垂体:2.19 甲状腺:0.93 副腎:- 膵臓:0.94 乳腺:2.11 唾液腺:2.01
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.41 卵巣:1.48 精巣:1.95 心臓:2.92 骨格筋:0.19 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.85     肝臓:0.15        肺:2.52    膀胱:- 腎臓:0.62 下垂体:- 甲状腺:0.70 副腎:0.51 膵臓:- 乳腺:0.78 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_030820
Gene ID 81578
Unigene ID Hs.47629
Probe set ID 208096_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000124749
GTEx ID ENSG00000124749

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]  
ラット [0]  

染色体

6p12.1  [55,921,388  -  56,258,892]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11230166
11566190
11827793
11863369
12477932
14702039
15342556
20379614
23817571
24132900

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030198  extracellular matrix organization

Cellular Component

GO:0005581  collagen
GO:0005788  endoplasmic reticulum lumen
GO:0031012  extracellular matrix
GO:0005576  extracellular region