sorting nexin family member 27

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同義遺伝子名

SNX27, MGC126873, MGC126871, sorting nexin family member 27, Sorting nexin-27, MGC20471, MY014, KIAA0488

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:68.70 小脳:50.40 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:296.70 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:474.60 目:52.90 動脈:- 静脈:- リンパ節:70.80 末梢血:54.70 脾臓:18.90 胸腺:38.70 骨髄:39.40 脂肪:121 骨:- 皮膚:33.60
GeneChip 大脳:7.20 小脳:7.10 脳幹:7.29 脳梁:7.08 松果体:- 末梢神経:6.59 脊柱:7.09 網膜:- 目:- 動脈:6.21 静脈:6.47 リンパ節:6.07 末梢血:- 脾臓:6.35 胸腺:5.86 骨髄:6.56 脂肪:6.16 骨:- 皮膚:6.03
CAGE 大脳:3.51 小脳:- 脳幹:3.20 脳梁:3.28 松果体:3.40 末梢神経:- 脊柱:3.17 網膜:- 目:- 動脈:2.12 静脈:2.35 リンパ節:2.08 末梢血:- 脾臓:2.53 胸腺:1.88 骨髄:- 脂肪:2.61 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.76 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.40 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.15 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:27.30 胎盤:91.10 前立腺:22.50 卵巣:37.30 精巣:38.90 心臓:25.50 骨格筋:80.40 食道:342.80 胃:21.20 腸:- 結腸:229     肝臓:21.10        肺:58.70    膀胱:- 腎臓:114.40 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:152.40 膵臓:97.80 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.28 胎盤:6.82 前立腺:6.41 卵巣:6.37 精巣:6.19 心臓:6.48 骨格筋:6.79 食道:6.12 胃:6.45 腸:6.33 結腸:6.45 肝臓:6.17 肺:6.32 膀胱:- 腎臓:7.25 下垂体:6.50 甲状腺:6.42 副腎:6.43 膵臓:5.43 乳腺:6.45 唾液腺:6.25
CAGE 子宮:2.81 胎盤:2.91 前立腺:2.87 卵巣:2.64 精巣:2.96 心臓:2.49 骨格筋:2.41 食道:2.41 胃:- 腸:2.05 結腸:2.36     肝臓:2.28    肺:2.47 膀胱:3.08 腎臓:3.10 下垂体:2.76 甲状腺:2.42 副腎:- 膵臓:2.34 乳腺:2.02 唾液腺:2.22
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.84 卵巣:3.29 精巣:3.27 心臓:2.75 骨格筋:3.40 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.02     肝臓:2.29        肺:2.77    膀胱:- 腎臓:3.63 下垂体:- 甲状腺:2.95 副腎:2.54 膵臓:- 乳腺:2.81 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_030918
Gene ID 81609
Unigene ID Hs.192326
Probe set ID 221498_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000143376
GTEx ID ENSG00000143376

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001082484, NM_029721
ラット[2]  NM_001110151, NM_152847

染色体

1q21.3  [151,584,541  -  151,671,567]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
9455484
11485546
12461558
12477932
14702039
15121882
15466885
16710414
17351151
17577583
17644068
17828261
18029348
18690037
19322201
19555689
19615732
20379614
20733053
21139048
21300787
21303929
21602791
21890473
21906983
21926430
21988832
22411990
23000965
23536889
23563491
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008333  endosome to lysosome transport
GO:0016197  endosome transport
GO:0001770  establishment of natural killer cell polarity
GO:0006886  intracellular protein transport
GO:0007165  signal transduction

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0005769  early endosome
GO:0031901  early endosome membrane
GO:0001772  immunological synapse
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0030904  retromer complex
GO:0071203  WASH complex

Molecular Function

GO:0032266  phosphatidylinositol 3-phosphate binding
GO:0005515  protein binding