exonuclease NEF-sp

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同義遺伝子名

DKFZp434J0315, exonuclease NEF-sp

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:45

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:118.60

目:17.60

動脈:-

静脈:-

リンパ節:70.80

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:-

皮膚:4.80

GeneChip

大脳:4.75

小脳:5.03

脳幹:4.76

脳梁:4.69

松果体:-

末梢神経:4.73

脊柱:4.81

網膜:-

目:-

動脈:4.99

静脈:5.09

リンパ節:4.80

末梢血:-

脾臓:4.63

胸腺:5.89

骨髄:5.96

脂肪:4.95

骨:-

皮膚:5.05

CAGE

大脳:1.13

小脳:-

脳幹:0.66

脳梁:0.99

松果体:1.00

末梢神経:-

脊柱:0.23

網膜:-

目:-

動脈:0.95

静脈:1.23

リンパ節:0.92

末梢血:-

脾臓:0.61

胸腺:2.30

骨髄:-

脂肪:1.21

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.59

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.19

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.60

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:3.60

前立腺:22.50

卵巣:-

精巣:1137.90

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:9.80

膀胱:-

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.92

胎盤:4.47

前立腺:5.80

卵巣:5.15

精巣:11.61

心臓:4.78

骨格筋:4.75

食道:4.92

胃:5.12

腸:5.12

結腸:5.04

肝臓:4.68

肺:4.90

膀胱:-

腎臓:4.68

下垂体:4.74

甲状腺:4.59

副腎:4.59

膵臓:5.04

乳腺:5.22

唾液腺:4.58

CAGE

子宮:0.90

胎盤:0.68

前立腺:1.36

卵巣:0.68

精巣:5.81

心臓:1.30

骨格筋:0.27

食道:0.82

胃:-

腸:0.93

結腸:1.17

肝臓:0.55

肺:0.95

膀胱:0.87

腎臓:0.88

下垂体:0.62

甲状腺:0.57

副腎:-

膵臓:0

乳腺:1.36

唾液腺:1.28

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.94

卵巣:0.70

精巣:6.78

心臓:0.40

骨格筋:0.08

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.42

肝臓:0.00

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.33

下垂体:-

甲状腺:0.55

副腎:0.27

膵臓:-

乳腺:1.13

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_030941
Gene ID	81691
Unigene ID	Hs.177926
Probe set ID	208107_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000005189
GTEx ID	ENSG00000005189

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001004187, NM_028129
ラット[1]	NM_001079706, NM_028129

染色体

16p12.3 [20,817,767 - 20,860,990]

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遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006055	Exonuclease
IPR013520	Exonuclease, RNase T/DNA polymerase III
IPR012337	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H fold
IPR000504	RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

10493829
11076863
11230166
11256614
12477932
14702039
15489336
16344560
16381901
19056867
21988832

遺伝子オントロジー (GO ID)

Cellular Component

Molecular Function

GO:0004527	exonuclease activity
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0003723	RNA binding