zinc finger (CCCH type), RNA-binding motif and serine/arginine rich 2

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同義遺伝子名

U2AF1-RS2, MGC142040, NY-REN-20 antigen, U2AF1RS2, U2AF1L2, MGC142014, ZRSR2, U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1-like 2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:5.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:11.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:80.90 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:6.96 小脳:6.80 脳幹:6.94 脳梁:7.02 松果体:- 末梢神経:6.91 脊柱:6.86 網膜:- 目:- 動脈:7.26 静脈:6.88 リンパ節:7.39 末梢血:- 脾臓:7.43 胸腺:7.12 骨髄:6.78 脂肪:6.87 骨:- 皮膚:6.66
CAGE 大脳:2.22 小脳:- 脳幹:2.31 脳梁:1.78 松果体:2.87 末梢神経:- 脊柱:2.82 網膜:- 目:- 動脈:2.08 静脈:1.76 リンパ節:2.15 末梢血:- 脾臓:2.25 胸腺:1.64 骨髄:- 脂肪:2.12 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.48 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.06 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.83 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:- 前立腺:45.10 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:8.50     肝臓:126.70        肺:14.70    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.07 胎盤:6.61 前立腺:6.63 卵巣:7.03 精巣:6.21 心臓:6.75 骨格筋:6.56 食道:6.59 胃:6.87 腸:6.51 結腸:6.55 肝臓:6.64 肺:7.21 膀胱:- 腎臓:6.46 下垂体:7.26 甲状腺:6.80 副腎:6.88 膵臓:6.16 乳腺:6.70 唾液腺:6.42
CAGE 子宮:2.33 胎盤:1.96 前立腺:2.23 卵巣:2.37 精巣:1.36 心臓:2.07 骨格筋:2.89 食道:2.14 胃:- 腸:2.05 結腸:1.67     肝臓:1.07    肺:2.25 膀胱:2.78 腎臓:2.12 下垂体:2.78 甲状腺:2.10 副腎:- 膵臓:0.94 乳腺:1.80 唾液腺:1.15
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.91 卵巣:3.19 精巣:2.47 心臓:1.77 骨格筋:2.10 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.37     肝臓:0.97        肺:2.46    膀胱:- 腎臓:2.58 下垂体:- 甲状腺:3.17 副腎:2.95 膵臓:- 乳腺:3.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_005089
Gene ID 8233
Unigene ID Hs.171909
Probe set ID 208174_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000169249
GTEx ID ENSG00000169249

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]  NM_009453, NM_178794, NM_011663
ラット [0]  

染色体

Xp22.2  [15,808,595  -  15,841,383]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1
IPR003954  RNA recognition, domain 1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8586425
9237760
10330123
10508479
12477932
14702039
15146077
15489334
17081983
19204726
21041408
21832049
22389253
23602568
24250222
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380  RNA splicing
GO:0000245  spliceosome assembly

Cellular Component

GO:0005689  U12-type spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0046872  metal ion binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0030628  pre-mRNA 3'-splice site binding
GO:0005515  protein binding