lysine (K)-specific demethylase 5D

同義遺伝子名

jumonji, AT rich interactive domain 1D, SMCY, HYA, Histocompatibility Y antigen, H-Y, KIAA0234, SmcY protein, JARID1D, Jumonji/ARID domain-containing protein 1D, HY

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:49.80

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:-

網膜:118.60

目:11.80

動脈:30

静脈:133.30

リンパ節:161.80

末梢血:-

脾臓:75.60

胸腺:180.40

骨髄:59

脂肪:80.70

骨:51.20

皮膚:24

GeneChip

大脳:5.52

小脳:6.23

脳幹:5.90

脳梁:5.63

松果体:-

末梢神経:5.67

脊柱:5.93

網膜:-

目:-

動脈:6.64

静脈:6.35

リンパ節:6.84

末梢血:-

脾臓:7.22

胸腺:6.19

骨髄:7

脂肪:6.64

骨:-

皮膚:6.01

CAGE

大脳:1.12

小脳:-

脳幹:1.68

脳梁:3.58

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0

網膜:-

目:-

動脈:3.37

静脈:3.61

リンパ節:3.39

末梢血:-

脾臓:3.32

胸腺:3.76

骨髄:-

脂肪:2.12

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.01

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:14.60

前立腺:56.30

卵巣:-

精巣:26

心臓:25.50

骨格筋:20.10

食道:-

胃:21.20

腸:-

結腸:25.40

肝臓:-

肺:44

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:35.60

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.09

胎盤:3.78

前立腺:7.66

卵巣:3.91

精巣:6.51

心臓:5.99

骨格筋:6.14

食道:6.13

胃:6.78

腸:5.67

結腸:5.10

肝臓:6.73

肺:5.91

膀胱:-

腎臓:6.70

下垂体:5.81

甲状腺:6.83

副腎:7.33

膵臓:4.83

乳腺:4.48

唾液腺:6.46

CAGE

子宮:0

胎盤:0

前立腺:3.46

卵巣:0

精巣:3.31

心臓:2.53

骨格筋:1.63

食道:2.62

胃:-

腸:3.20

結腸:1.68

肝臓:2.10

肺:2.91

膀胱:2.14

腎臓:0

下垂体:0

甲状腺:2.13

副腎:-

膵臓:2.98

乳腺:0

唾液腺:3.24

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.22

卵巣:0.00

精巣:2.11

心臓:0.00

骨格筋:0.06

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0

肝臓:0.44

肺:1.62

膀胱:-

腎臓:0

下垂体:-

甲状腺:0.00

副腎:2.09

膵臓:-

乳腺:0

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001146706
Gene ID	8284
Unigene ID	Hs.80358
Probe set ID	206700_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000012817
GTEx ID	ENSG00000012817

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_011419
ラット[2]	NM_011419

染色体

Yq11.222 [21,865,751 - 21,906,825]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347	Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787	Zinc finger, PHD-finger
IPR001965	Zinc finger, PHD-type

GO:0034720	histone H3-K4 demethylation
GO:0007283	spermatogenesis

GO:0005575	cellular_component
GO:0005634	nucleus

GO:0003677	DNA binding
GO:0032453	histone demethylase activity (H3-K4 specific)
GO:0003674	molecular_function
GO:0016706	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702	oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0008270	zinc ion binding

lysine (K)-specific demethylase 5D

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function