transformation/transcription domain-associated protein

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同義遺伝子名

PAF400, 350/400 kDa PCAF-associated factor, STAF40, Tra1, FLJ10671, TRRAP, Tra1 homolog, PAF350/400, TR-AP

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:4.91

小脳:5.02

脳幹:4.69

脳梁:5

松果体:-

末梢神経:4.66

脊柱:4.92

網膜:-

目:-

動脈:4.68

静脈:4.42

リンパ節:4.85

末梢血:-

脾臓:5.15

胸腺:6.90

骨髄:5.20

脂肪:4.89

骨:-

皮膚:5.23

CAGE

大脳:3.36

小脳:-

脳幹:3.20

脳梁:3.51

松果体:3.93

末梢神経:-

脊柱:3.49

網膜:-

目:-

動脈:3.44

静脈:3.55

リンパ節:3.61

末梢血:-

脾臓:3.44

胸腺:4.21

骨髄:-

脂肪:3.06

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.28

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.05

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.95

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:5.41

胎盤:5.43

前立腺:5.60

卵巣:5.73

精巣:6.19

心臓:4.61

骨格筋:4.58

食道:4.97

胃:5.03

腸:5.08

結腸:5.40

肝臓:4.51

肺:4.61

膀胱:-

腎臓:4.87

下垂体:5.31

甲状腺:4.78

副腎:4.58

膵臓:4.94

乳腺:5.03

唾液腺:4.63

CAGE

子宮:3.56

胎盤:3.22

前立腺:3.36

卵巣:3.37

精巣:3.32

心臓:3.14

骨格筋:2.76

食道:2.83

胃:-

腸:3.18

結腸:3.39

肝臓:2.99

肺:3.29

膀胱:2.77

腎臓:2.85

下垂体:4.07

甲状腺:3.29

副腎:-

膵臓:2.98

乳腺:3.66

唾液腺:3.29

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.79

卵巣:2.38

精巣:2.41

心臓:1.35

骨格筋:1.07

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.32

肝臓:0.97

肺:1.62

膀胱:-

腎臓:1.74

下垂体:-

甲状腺:2.20

副腎:2.10

膵臓:-

乳腺:1.54

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003496
Gene ID	8295
Unigene ID	-
Probe set ID	214908_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000196367
GTEx ID	ENSG00000196367

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_001081362
ラット[1]	NM_001105907

染色体

7q22.1 [98,475,556 - 98,610,866]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000403	Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic
IPR014009	PIK-related kinase
IPR011009	Protein kinase-like domain

GO:0016573	histone acetylation
GO:0016578	histone deubiquitination
GO:0043968	histone H2A acetylation
GO:0043967	histone H4 acetylation
GO:0007093	mitotic cell cycle checkpoint
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

GO:0035267	NuA4 histone acetyltransferase complex
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0000125	PCAF complex
GO:0030914	STAGA complex
GO:0033276	transcription factor TFTC complex

GO:0016773	phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor
GO:0005515	protein binding
GO:0003713	transcription coactivator activity
GO:0003712	transcription cofactor activity

transformation/transcription domain-associated protein

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function