eomesodermin homolog (Xenopus laevis)

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同義遺伝子名

TBR2, EOMES, eomesodermin homolog (Xenopus laevis), eomesodermin (Xenopus laevis) homolog, Eomesodermin homolog

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:21.30 小脳:50.40 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:11.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.10 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:14.40
GeneChip nodata
CAGE 大脳:0.47 小脳:- 脳幹:0.42 脳梁:0.18 松果体:0.21 末梢神経:- 脊柱:0.46 網膜:- 目:- 動脈:1.52 静脈:2.40 リンパ節:2.24 末梢血:- 脾臓:2.96 胸腺:0.91 骨髄:- 脂肪:0.84 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.04 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.33 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.06 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:27.30 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:8.70 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:1.25 胎盤:0.85 前立腺:1.21 卵巣:0.79 精巣:0.40 心臓:0.40 骨格筋:0.17 食道:0.82 胃:- 腸:0.33 結腸:0.64     肝臓:1.54    肺:2.15 膀胱:1.38 腎臓:0.67 下垂体:0.34 甲状腺:0.67 副腎:- 膵臓:0.58 乳腺:0.90 唾液腺:1.15
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.17 卵巣:0.20 精巣:0.44 心臓:0.07 骨格筋:0.06 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0.39        肺:1.48    膀胱:- 腎臓:0.09 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:1.33 膵臓:- 乳腺:0.08 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_005442
Gene ID 8320
Unigene ID Hs.591663
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000163508
GTEx ID ENSG00000163508

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]  NM_001164789, NM_010136
ラット[3]  NM_001164789, NM_010136

染色体

3p24.1  [27,757,440  -  27,764,206]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001699  Transcription factor, T-box

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
9888994
10407135
12477932
15489334
16273099
17353897
17566017
18523274
18794345
18940588
18973570
19036723
19269192
20056084
20498708
21076068
21245162
21833088
21900206
22190364
22490682
23056278
23313847
23455505
23609452
23965471
24149102
24495857

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007420  brain development
GO:0010002  cardioblast differentiation
GO:0002302  CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation during immune response
GO:0060706  cell differentiation involved in embryonic placenta development
GO:0021895  cerebral cortex neuron differentiation
GO:0001706  endoderm formation
GO:0001714  endodermal cell fate specification
GO:0032609  interferon-gamma production
GO:0001707  mesoderm formation
GO:0060809  mesodermal to mesenchymal transition involved in gastrulation
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0021772  olfactory bulb development
GO:0045597  positive regulation of cell differentiation
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0045664  regulation of neuron differentiation
GO:0019827  stem cell maintenance
GO:0001829  trophectodermal cell differentiation

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity