histone deacetylase 10

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

DKFZP761B039, histone deacetylase 10, Histone deacetylase 10, HDAC10, HD10

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:28.40 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:17.60 動脈:30 静脈:- リンパ節:192.10 末梢血:200.40 脾臓:18.90 胸腺:51.50 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:- 皮膚:9.60
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.26 小脳:- 脳幹:2.02 脳梁:1.99 松果体:2.60 末梢神経:- 脊柱:1.91 網膜:- 目:- 動脈:2.00 静脈:3.11 リンパ節:2.93 末梢血:- 脾臓:2.85 胸腺:2.80 骨髄:- 脂肪:2.48 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.30 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.68 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.26 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:36.40 前立腺:- 卵巣:37.30 精巣:8.70 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:127.50 腸:- 結腸:33.90     肝臓:10.60        肺:-    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:44.50 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.42 胎盤:2.19 前立腺:2.52 卵巣:2.23 精巣:1.54 心臓:1.63 骨格筋:0.99 食道:2.55 胃:- 腸:2.87 結腸:2.95     肝臓:2.28    肺:2.46 膀胱:1.92 腎臓:2.03 下垂体:2.57 甲状腺:2.05 副腎:- 膵臓:2.41 乳腺:1.53 唾液腺:2.63
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.97 卵巣:1.64 精巣:1.16 心臓:0.43 骨格筋:0.62 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.04     肝臓:1.57        肺:1.79    膀胱:- 腎臓:1.15 下垂体:- 甲状腺:1.98 副腎:2.72 膵臓:- 乳腺:1.71 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_032019
Gene ID 83933
Unigene ID Hs.26593
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000100429
GTEx ID ENSG00000100429

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_199198
ラット [0]  

染色体

22q13.33  [50,683,612  -  50,689,834]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000286  Histone deacetylase superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10591208
11677242
11726666
11739383
11861901
12477932
14578343
14670976
14759258
15305372
15461802
15489334
17172643
17892858
19913121
20032463
20471694
20628086
20680488
21247901
22505724
22730529
22989952
23752268
23801752
23897811

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0016575  histone deacetylation
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007219  Notch signaling pathway
GO:0014003  oligodendrocyte development
GO:0006476  protein amino acid deacetylation
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0000118  histone deacetylase complex
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0019899  enzyme binding
GO:0004407  histone deacetylase activity
GO:0042826  histone deacetylase binding
GO:0032041  NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
GO:0046969  NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific)
GO:0046970  NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific)
GO:0005515  protein binding
GO:0033558  protein deacetylase activity