BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1

同義遺伝子名

FANCJ, Protein FACJ, BRCA1-interacting protein 1, FLJ90232, BRIP1, BACH1, MGC126521, BRCA1-interacting protein C-terminal helicase 1, BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1, Fanconi anemia group J protein, ATP-dependent RNA helicase BRIP1, MGC126523, BRCA1-associated C-terminal helicase 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:1.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:40.40

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:2.79

小脳:2.88

脳幹:2.82

脳梁:2.73

松果体:-

末梢神経:2.77

脊柱:2.86

網膜:-

目:-

動脈:2.78

静脈:2.79

リンパ節:2.82

末梢血:-

脾臓:2.77

胸腺:3.89

骨髄:3.04

脂肪:2.80

骨:-

皮膚:2.79

CAGE

大脳:0.33

小脳:-

脳幹:0.19

脳梁:0.13

松果体:0.26

末梢神経:-

脊柱:0.13

網膜:-

目:-

動脈:0

静脈:0.88

リンパ節:1.03

末梢血:-

脾臓:0.95

胸腺:2.90

骨髄:-

脂肪:0.78

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.12

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.06

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.10

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:112.50

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:25.40

肝臓:10.60

肺:-

膀胱:-

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:83.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:2.94

胎盤:2.83

前立腺:2.79

卵巣:2.96

精巣:2.85

心臓:2.82

骨格筋:2.77

食道:2.89

胃:2.77

腸:2.79

結腸:2.80

肝臓:2.76

肺:2.72

膀胱:-

腎臓:2.73

下垂体:2.90

甲状腺:2.76

副腎:2.83

膵臓:2.91

乳腺:2.83

唾液腺:2.80

CAGE

子宮:0.73

胎盤:0.68

前立腺:0.44

卵巣:0.60

精巣:1.73

心臓:0.11

骨格筋:0

食道:1.14

胃:-

腸:1.50

結腸:1.34

肝臓:0.26

肺:0.36

膀胱:0.26

腎臓:0.08

下垂体:0.10

甲状腺:0

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.14

卵巣:0.16

精巣:1.72

心臓:0.06

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.05

肝臓:0.15

肺:0.09

膀胱:-

腎臓:0.03

下垂体:-

甲状腺:0.04

副腎:0.27

膵臓:-

乳腺:0.15

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_032043
Gene ID	83990
Unigene ID	Hs.532799
Probe set ID	221703_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000136492
GTEx ID	ENSG00000136492

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_178309
ラット[1]	NM_178309

染色体

17q23.2 [59,759,985 - 59,940,755]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR010614	DEAD2
IPR013020	DNA helicase (DNA repair), Rad3 type
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR014013	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain, DinG/Rad3-type
IPR006554	Helicase-like, DEXD box c2 type

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0000077	DNA damage checkpoint
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0031965	nuclear membrane
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0051539	4 iron, 4 sulfur cluster binding
GO:0005524	ATP binding
GO:0004003	ATP-dependent DNA helicase activity
GO:0003677	DNA binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0005515	protein binding

BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function