obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF

同義遺伝子名

Obscurin-myosin light chain kinase, Obscurin-MLCK, UNC89, FLJ14124, DKFZp666E245, MGC120412, MGC120410, OBSCN, KIAA1639, Obscurin, Obscurin-RhoGEF, KIAA1556, MGC120411, MGC138590, MGC120409

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:0.04

小脳:-

脳幹:0.03

脳梁:0.13

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0.13

網膜:-

目:-

動脈:0.18

静脈:1.89

リンパ節:1.07

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:1.88

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.05

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.43

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.08

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:0.09

胎盤:0.08

前立腺:0.21

卵巣:0

精巣:0.40

心臓:3.81

骨格筋:5.80

食道:1.73

胃:-

腸:0.57

結腸:1.07

肝臓:0

肺:0.71

膀胱:0.18

腎臓:0

下垂体:0.32

甲状腺:1.57

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:1.39

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.32

卵巣:0.58

精巣:0.88

心臓:2.94

骨格筋:5.22

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.28

肝臓:0.03

肺:0.36

膀胱:-

腎臓:0.17

下垂体:-

甲状腺:2.30

副腎:0.37

膵臓:-

乳腺:0.76

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001098623
Gene ID	84033
Unigene ID	Hs.650039
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000154358
GTEx ID	ENSG00000154358

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]
ラット [0]

染色体

1q42.13 [228,395,831 - 228,566,575]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007275	multicellular organismal development
GO:0048011	nerve growth factor receptor signaling pathway
GO:0043065	positive regulation of apoptosis
GO:0035023	regulation of Rho protein signal transduction
GO:0051056	regulation of small GTPase mediated signal transduction
GO:0045214	sarcomere organization
GO:0007264	small GTPase mediated signal transduction

Cellular Component

GO:0005829	cytosol
GO:0031430	M band
GO:0030016	myofibril
GO:0030018	Z disc

Molecular Function

GO:0030506	ankyrin binding
GO:0005524	ATP binding
GO:0005516	calmodulin binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0005543	phospholipid binding
GO:0005515	protein binding
GO:0004674	protein serine/threonine kinase activity
GO:0004713	protein tyrosine kinase activity
GO:0005089	Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0008307	structural constituent of muscle
GO:0031432	titin binding

IPR003961	Fibronectin, type III
IPR008957	Fibronectin, type III-like fold
IPR013106	Immunoglobulin V-set
IPR003596	Immunoglobulin V-set, subgroup
IPR001849	Pleckstrin homology
IPR000719	Protein kinase, catalytic domain
IPR011009	Protein kinase-like domain
IPR002290	Serine/threonine-protein kinase domain
IPR017442	Serine/threonine-protein kinase-like domain
IPR001245	Tyrosine-protein kinase, catalytic domain
IPR020635	Tyrosine-protein kinase, subgroup, catalytic domain

obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function