speckle-type POZ protein

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同義遺伝子名

Speckle-type POZ protein, SPOP, speckle-type POZ protein, TEF2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:126.80

小脳:176.30

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:148.30

末梢神経:153.40

脊柱:112.30

網膜:-

目:135.20

動脈:599.50

静脈:266.60

リンパ節:70.80

末梢血:164

脾臓:151.30

胸腺:103.10

骨髄:59

脂肪:121

骨:38.40

皮膚:211.20

GeneChip

大脳:7.97

小脳:8.33

脳幹:7.83

脳梁:8.01

松果体:-

末梢神経:8.12

脊柱:7.87

網膜:-

目:-

動脈:8.67

静脈:8.46

リンパ節:8.01

末梢血:-

脾臓:8.25

胸腺:8.38

骨髄:7.52

脂肪:7.89

骨:-

皮膚:7.75

CAGE

大脳:3.98

小脳:-

脳幹:3.94

脳梁:4.05

松果体:3.88

末梢神経:-

脊柱:3.83

網膜:-

目:-

動脈:4.15

静脈:3.86

リンパ節:3.63

末梢血:-

脾臓:3.74

胸腺:4.02

骨髄:-

脂肪:3.93

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.45

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.12

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:200.50

胎盤:127.50

前立腺:236.60

卵巣:74.50

精巣:73.50

心臓:140.50

骨格筋:80.40

食道:342.80

胃:148.70

腸:129.60

結腸:186.60

肝臓:42.20

肺:146.60

膀胱:-

腎臓:187.10

下垂体:347.90

甲状腺:163.70

副腎:101.60

膵臓:26.70

乳腺:158

唾液腺:328.40

GeneChip

子宮:8.75

胎盤:7.34

前立腺:9.05

卵巣:8.42

精巣:7.49

心臓:7.87

骨格筋:7.78

食道:8.11

胃:8.41

腸:7.67

結腸:7.68

肝臓:7.92

肺:8.16

膀胱:-

腎臓:7.63

下垂体:8.22

甲状腺:8.23

副腎:7.98

膵臓:6.91

乳腺:8.16

唾液腺:7.96

CAGE

子宮:4.31

胎盤:3.61

前立腺:3.94

卵巣:3.89

精巣:3.42

心臓:3.65

骨格筋:3.31

食道:3.61

胃:-

腸:3.70

結腸:3.80

肝臓:3.56

肺:3.83

膀胱:3.90

腎臓:3.45

下垂体:4.03

甲状腺:4.02

副腎:-

膵臓:3.65

乳腺:3.54

唾液腺:4.11

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.29

卵巣:0.07

精巣:0.20

心臓:0.29

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.21

肝臓:0.09

肺:0.01

膀胱:-

腎臓:0.20

下垂体:-

甲状腺:0.17

副腎:0.15

膵臓:-

乳腺:0.24

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003563
Gene ID	8405
Unigene ID	Hs.463382
Probe set ID	204640_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000121067
GTEx ID	ENSG00000121067

オーソログ対応遺伝子

マウス[11]	NM_025287, NM_207271, NM_148949, NM_207272, NM_001146107, NM_001163731, NM_207273, NM_001163730, NM_001034860, NM_001177694
ラット[4]	NM_001100496, NM_001100996, NM_001100985, NM_207272, NM_001146107, NM_001163731, NM_207273, NM_001163730, NM_001034860, NM_001177694

染色体

17q21.33 [47,676,246 - 47,755,596]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR011333	BTB/POZ fold
IPR000210	BTB/POZ-like
IPR002083	MATH
IPR008974	TRAF-like

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0043161	proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0016567	protein ubiquitination

Cellular Component

GO:0031463	Cul3-RING ubiquitin ligase complex
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0005515	protein binding
GO:0031625	ubiquitin protein ligase binding

speckle-type POZ protein

同義遺伝子名

発現データ

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組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function