chromodomain helicase DNA binding protein 6

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同義遺伝子名

CHD6, dJ620E11.1, Radiation-induced gene B protein, KIAA1335, chromodomain helicase DNA binding protein 6, RIGB, CHD-6, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 6, ATP-dependent helicase CHD6, FLJ22369

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:79.40 小脳:88.20 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:153.40 脊柱:- 網膜:118.60 目:88.20 動脈:30 静脈:- リンパ節:60.70 末梢血:36.40 脾臓:- 胸腺:103.10 骨髄:137.80 脂肪:- 骨:51.20 皮膚:81.60
GeneChip nodata
CAGE 大脳:4.02 小脳:- 脳幹:4.18 脳梁:4.10 松果体:4.33 末梢神経:- 脊柱:4.21 網膜:- 目:- 動脈:3.82 静脈:3.73 リンパ節:3.72 末梢血:- 脾臓:3.62 胸腺:4.11 骨髄:- 脂肪:3.70 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.71 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.14 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.19 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:54.70 胎盤:32.80 前立腺:101.40 卵巣:37.30 精巣:103.80 心臓:89.40 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:76.30     肝臓:63.30        肺:63.50    膀胱:- 腎臓:93.60 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:35.60 乳腺:260.20 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:4.27 胎盤:3.31 前立腺:3.76 卵巣:3.73 精巣:3.68 心臓:3.41 骨格筋:3.21 食道:3.41 胃:- 腸:3.03 結腸:3.31     肝臓:2.90    肺:3.52 膀胱:3.80 腎臓:3.40 下垂体:4.39 甲状腺:3.70 副腎:- 膵臓:3.10 乳腺:2.99 唾液腺:3.64
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.71 卵巣:2.88 精巣:2.61 心臓:2.19 骨格筋:1.28 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.14     肝臓:1.19        肺:1.99    膀胱:- 腎臓:2.07 下垂体:- 甲状腺:3.08 副腎:2.64 膵臓:- 乳腺:2.16 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_032221
Gene ID 84181
Unigene ID Hs.371979
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000124177
GTEx ID ENSG00000124177

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_173368
ラット[1]  NM_001107797

染色体

20q12  [40,030,741  -  40,247,133]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953  Chromo domain
IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10718198
11780052
11889561
12168954
12477932
14702039
15231748
15489334
16314513
16713569
17027977
17081983
17525332
20085707
20379614
20631145
20936779
21139048
21899694
22745009
23408615
23667531

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0007399  nervous system development
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0008026  ATP-dependent helicase activity
GO:0003682  chromatin binding
GO:0003677  DNA binding