beaded filament structural protein 2, phakinin

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同義遺伝子名

MGC142078, LIFL-L, Phakinin, beaded filament structural protein 2, phakinin, BFSP2, CP47, Lens intermediate filament-like light, Beaded filament structural protein 2, MGC142080, phakinin, Lens fiber cell beaded filament protein CP 49, 49 kDa cytoskeletal protein, CP 47, CP49

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:3.91 小脳:3.84 脳幹:3.92 脳梁:3.80 松果体:- 末梢神経:3.92 脊柱:3.82 網膜:- 目:- 動脈:4.25 静脈:4.13 リンパ節:4.08 末梢血:- 脾臓:3.92 胸腺:4.01 骨髄:4.01 脂肪:4.16 骨:- 皮膚:4.25
CAGE 大脳:0 小脳:- 脳幹:0 脳梁:0 松果体:0 末梢神経:- 脊柱:0 網膜:- 目:- 動脈:0 静脈:0 リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.02 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.47 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:4.02 胎盤:4.13 前立腺:3.85 卵巣:3.93 精巣:3.88 心臓:3.91 骨格筋:3.97 食道:3.85 胃:3.92 腸:4.26 結腸:4.10 肝臓:3.90 肺:3.97 膀胱:- 腎臓:3.85 下垂体:3.96 甲状腺:3.91 副腎:3.88 膵臓:4.48 乳腺:3.92 唾液腺:4.10
CAGE 子宮:0 胎盤:0 前立腺:0 卵巣:0 精巣:0 心臓:0 骨格筋:0 食道:0 胃:- 腸:0 結腸:0     肝臓:0    肺:0 膀胱:0 腎臓:0 下垂体:0 甲状腺:0 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.01 卵巣:0.03 精巣:0.04 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0.39 膵臓:- 乳腺:0.06 唾液腺:-

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IDs

Refseq ID NM_003571
Gene ID 8419
Unigene ID -
Probe set ID 207399_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000170819
GTEx ID ENSG00000170819

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001002896
ラット[2]  NM_001002896

染色体

3q22.1  [133,118,839  -  133,194,066]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001664  Intermediate filament protein
IPR002957  Keratin, type I

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7504675
7720401
8636093
8889548
9628810
10729115
10739768
10753642
12477932
15489334
15570218
17200662
17982427
18029348
18958306
21836522

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0048469  cell maturation
GO:0045104  intermediate filament cytoskeleton organization
GO:0070307  lens fiber cell development
GO:0050896  response to stimulus
GO:0007601  visual perception

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005882  intermediate filament
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005200  structural constituent of cytoskeleton
GO:0005212  structural constituent of eye lens