calsequestrin 1 (fast-twitch, skeletal muscle)

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同義遺伝子名

calsequestrin 1 (fast-twitch, skeletal muscle), Calsequestrin, skeletal muscle isoform, Calmitin, PDIB1, Calsequestrin-1 precursor, CASQ1, CASQ

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:11.90 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:29.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2379.70 骨:- 皮膚:81.60
GeneChip 大脳:4.48 小脳:4.24 脳幹:4.16 脳梁:4.06 松果体:- 末梢神経:3.87 脊柱:4.17 網膜:- 目:- 動脈:4.03 静脈:4.42 リンパ節:4.08 末梢血:- 脾臓:3.80 胸腺:3.64 骨髄:3.92 脂肪:4.03 骨:- 皮膚:4.63
CAGE 大脳:1.12 小脳:- 脳幹:0.38 脳梁:0.59 松果体:0.71 末梢神経:- 脊柱:0.13 網膜:- 目:- 動脈:1.10 静脈:3.18 リンパ節:1.62 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:3.52 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.82 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.84 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.15 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:7.30 前立腺:33.80 卵巣:- 精巣:- 心臓:89.40 骨格筋:1687.60 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:-     肝臓:52.80        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.67 胎盤:3.93 前立腺:3.96 卵巣:3.71 精巣:3.99 心臓:5.03 骨格筋:10.71 食道:6.63 胃:4.01 腸:5.26 結腸:4.15 肝臓:3.95 肺:3.75 膀胱:- 腎臓:4.09 下垂体:3.93 甲状腺:3.83 副腎:4.04 膵臓:4.09 乳腺:3.76 唾液腺:4.17
CAGE 子宮:0.26 胎盤:0.08 前立腺:1.00 卵巣:0.20 精巣:0.40 心臓:2.29 骨格筋:6.56 食道:3.07 胃:- 腸:0.57 結腸:0.32     肝臓:0    肺:0.10 膀胱:1.18 腎臓:0 下垂体:0.24 甲状腺:1.80 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:1.95
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.06 卵巣:0.53 精巣:3.15 心臓:4.04 骨格筋:6.63 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.68     肝臓:0.06        肺:0.07    膀胱:- 腎臓:0.16 下垂体:- 甲状腺:5.56 副腎:1.48 膵臓:- 乳腺:5.06 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001231
Gene ID 844
Unigene ID Hs.632476
Probe set ID 219645_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000143318
GTEx ID ENSG00000143318

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_009813
ラット[1]  NM_001159594

染色体

1q23.2  [160,160,285  -  160,171,676]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

2321095
7599203
7666833
7945294
8406504
8660374
9125222
12477932
15489334
15561962
15561963
16344560
17009399
17681849
18269685
18452871
20682687
22060633
22337878
23460944
23792176

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007029  endoplasmic reticulum organization
GO:0034220  ion transmembrane transport
GO:0051282  regulation of sequestering of calcium ion
GO:0014809  regulation of skeletal muscle contraction by regulation of release of sequestered calcium ion
GO:0014894  response to denervation involved in regulation of muscle adaptation
GO:0009408  response to heat
GO:0010033  response to organic substance
GO:0007519  skeletal muscle tissue development
GO:0055085  transmembrane transport

Cellular Component

GO:0005783  endoplasmic reticulum
GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0031674  I band
GO:0005759  mitochondrial matrix
GO:0033017  sarcoplasmic reticulum membrane
GO:0005790  smooth endoplasmic reticulum
GO:0030315  T-tubule
GO:0014804  terminal cisterna lumen

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding