calsequestrin 2 (cardiac muscle)

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同義遺伝子名

PDIB2, Calsequestrin-2 precursor, CASQ2, calsequestrin 2 (cardiac muscle), Calsequestrin, cardiac muscle isoform, FLJ26321

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:5.90 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:112.30 網膜:- 目:58.80 動脈:- 静脈:133.30 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:484 骨:12.80 皮膚:28.80
GeneChip 大脳:5.80 小脳:6.11 脳幹:5.70 脳梁:5.73 松果体:- 末梢神経:6.26 脊柱:5.66 網膜:- 目:- 動脈:8.45 静脈:10.18 リンパ節:5.78 末梢血:- 脾臓:5.34 胸腺:5.14 骨髄:5.56 脂肪:6.59 骨:- 皮膚:6.61
CAGE 大脳:0.95 小脳:- 脳幹:1.04 脳梁:1.55 松果体:0.74 末梢神経:- 脊柱:1.12 網膜:- 目:- 動脈:3.73 静脈:2.77 リンパ節:1.55 末梢血:- 脾臓:0.39 胸腺:0.18 骨髄:- 脂肪:3.13 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.09 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.13 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.88 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:54.70 胎盤:3.60 前立腺:78.90 卵巣:- 精巣:- 心臓:906.80 骨格筋:301.40 食道:342.80 胃:- 腸:97.20 結腸:33.90     肝臓:10.60        肺:24.40    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.41 胎盤:5.48 前立腺:6.15 卵巣:5.72 精巣:5.17 心臓:10.49 骨格筋:10.02 食道:7.71 胃:6.82 腸:7.27 結腸:7.01 肝臓:5.55 肺:5.95 膀胱:- 腎臓:5.66 下垂体:5.68 甲状腺:5.72 副腎:6.21 膵臓:5.56 乳腺:6.78 唾液腺:5.79
CAGE 子宮:3.23 胎盤:1.11 前立腺:4.00 卵巣:3.04 精巣:1.54 心臓:5.80 骨格筋:4.87 食道:4.05 胃:- 腸:2.65 結腸:2.99     肝臓:0.36    肺:1.80 膀胱:4.98 腎臓:1.40 下垂体:0.24 甲状腺:2.01 副腎:- 膵臓:0.58 乳腺:1.92 唾液腺:1.49
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:5.83 卵巣:1.76 精巣:3.86 心臓:8.64 骨格筋:4.98 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:5.24     肝臓:0.24        肺:2.82    膀胱:- 腎臓:1.08 下垂体:- 甲状腺:5.06 副腎:4.36 膵臓:- 乳腺:3.64 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001232
Gene ID 845
Unigene ID Hs.57975
Probe set ID 207317_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000118729
GTEx ID ENSG00000118729

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_009814
ラット [0]  

染色体

1p13.1  [116,242,628  -  116,311,435]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1985907
7721813
8125298
8406504
8889548
9287354
9795116
10748065
10825439
11069905
11113462
11704930
12386154
12477932
12732448
12858557
14571276
14638677
15050380
15485681
15489334
15698842
16601229
16908766
17045261
17531962
17569730
17607358
17655857
17881003
17938175
18399795
18469084
18543230
18669926
19357236
19376574
19398665
19403607
19709828
20039900
20301466
20302875
21063088
21265816
21416293
21618644
21685173
21872879
22050625
22123818
22421959
22481011
22650415
23595086

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0060048  cardiac muscle contraction
GO:0071313  cellular response to caffeine
GO:0005513  detection of calcium ion
GO:0034220  ion transmembrane transport
GO:0043267  negative regulation of potassium ion transport
GO:0060315  negative regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity
GO:0051258  protein polymerization
GO:0010881  regulation of cardiac muscle contraction by regulation of the release of sequestered calcium ion
GO:0010649  regulation of cell communication by electrical coupling
GO:0002027  regulation of heart rate
GO:0060306  regulation of membrane repolarization
GO:0010880  regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum
GO:0051208  sequestering of calcium ion
GO:0006941  striated muscle contraction
GO:0055085  transmembrane transport

Cellular Component

GO:0034704  calcium channel complex
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005622  intracellular
GO:0014701  junctional sarcoplasmic reticulum membrane
GO:0016529  sarcoplasmic reticulum
GO:0033018  sarcoplasmic reticulum lumen
GO:0033017  sarcoplasmic reticulum membrane
GO:0005891  voltage-gated calcium channel complex
GO:0030018  Z disc

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding
GO:0005515  protein binding
GO:0042803  protein homodimerization activity