collagen, type XXV, alpha 1

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同義遺伝子名

COL25A1, CLAC, collagen, type XXV, alpha 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 大脳:1.29 小脳:- 脳幹:0.32 脳梁:0.76 松果体:0.47 末梢神経:- 脊柱:0.92 網膜:- 目:- 動脈:1.52 静脈:1.95 リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:0.09 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:2.58 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.02 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 子宮:1.22 胎盤:0 前立腺:0.70 卵巣:0.92 精巣:1.79 心臓:1.33 骨格筋:0.79 食道:0.86 胃:- 腸:0.38 結腸:0.38     肝臓:1.12    肺:0.31 膀胱:1.24 腎臓:1.58 下垂体:3.09 甲状腺:1.67 副腎:- 膵臓:0 乳腺:2.11 唾液腺:2.43
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0 卵巣:0 精巣:0.00 心臓:0.00 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_032518
Gene ID 84570
Unigene ID -
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000188517
GTEx ID ENSG00000188517

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_029838, NM_198711
ラット[2]  NM_029838, NM_198711

染色体

4q25  [109,731,877  -  110,223,813]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11927537
12477932
14656069
14702039
15215182
15522881
15615705
15853808
16300410
18501477
19548013
20332099
20379614
21408207
21688384
22297151
23018867

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030574  collagen catabolic process
GO:0022617  extracellular matrix disassembly
GO:0030198  extracellular matrix organization

Cellular Component

GO:0005581  collagen
GO:0005788  endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576  extracellular region
GO:0005615  extracellular space
GO:0016021  integral to membrane
GO:0005887  integral to plasma membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0001540  beta-amyloid binding
GO:0008201  heparin binding