collagen, type XXV, alpha 1

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同義遺伝子名

COL25A1, CLAC, collagen, type XXV, alpha 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:1.29

小脳:-

脳幹:0.32

脳梁:0.76

松果体:0.47

末梢神経:-

脊柱:0.92

網膜:-

目:-

動脈:1.52

静脈:1.95

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0.09

胸腺:0.06

骨髄:-

脂肪:2.58

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.72

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.28

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.22

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:1.22

胎盤:0

前立腺:0.70

卵巣:0.92

精巣:1.79

心臓:1.33

骨格筋:0.79

食道:0.86

胃:-

腸:0.38

結腸:0.38

肝臓:1.12

肺:0.31

膀胱:1.24

腎臓:1.58

下垂体:3.09

甲状腺:1.67

副腎:-

膵臓:0

乳腺:2.11

唾液腺:2.43

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.20

卵巣:0.24

精巣:0.53

心臓:0.08

骨格筋:0.21

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.56

肝臓:0.16

肺:0.15

膀胱:-

腎臓:0.74

下垂体:-

甲状腺:0.73

副腎:0.25

膵臓:-

乳腺:0.78

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_198721
Gene ID	84570
Unigene ID	-
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000188517
GTEx ID	ENSG00000188517

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_029838, NM_198711
ラット[2]	NM_029838, NM_198711

染色体

4q25 [109,731,877 - 110,223,813]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization

Cellular Component

GO:0005581	collagen
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space
GO:0016021	integral to membrane
GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0001540	beta-amyloid binding
GO:0008201	heparin binding

collagen, type XXV, alpha 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function