lysine (K)-specific demethylase 2B

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同義遺伝子名

Protein JEMMA, FBL10, CXXC2, JHDM1B, F-box protein FBL10, FBXL10, PCCX2, Fbl10, Protein-containing CXXC domain 2, CXXC-type zinc finger protein 2, F-box/LRR-repeat protein 10, F-box and leucine-rich repeat protein 10

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:55.70 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:153.40 脊柱:- 網膜:- 目:76.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:121.30 末梢血:18.20 脾臓:- 胸腺:25.80 骨髄:39.40 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:57.60
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.65 小脳:- 脳幹:2.65 脳梁:2.89 松果体:2.44 末梢神経:- 脊柱:2.76 網膜:- 目:- 動脈:2.59 静脈:2.99 リンパ節:3.10 末梢血:- 脾臓:2.49 胸腺:3.27 骨髄:- 脂肪:2.25 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.13 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.58 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.64 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:72.90 胎盤:25.50 前立腺:45.10 卵巣:- 精巣:38.90 心臓:38.30 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:- 結腸:25.40     肝臓:-        肺:34.20    膀胱:- 腎臓:72.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.29 胎盤:2.31 前立腺:2.11 卵巣:1.87 精巣:2.63 心臓:2.00 骨格筋:1.05 食道:2.23 胃:- 腸:2.12 結腸:2.50     肝臓:1.54    肺:2.65 膀胱:2.08 腎臓:1.60 下垂体:2.10 甲状腺:1.97 副腎:- 膵臓:2.54 乳腺:2.11 唾液腺:2.26
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.14 卵巣:2.93 精巣:2.90 心臓:1.11 骨格筋:1.34 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.54     肝臓:1.48        肺:1.71    膀胱:- 腎臓:1.65 下垂体:- 甲状腺:2.00 副腎:2.91 膵臓:- 乳腺:2.04 唾液腺:-

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IDs

Refseq ID NM_032590
Gene ID 84678
Unigene ID Hs.524800
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000089094
GTEx ID ENSG00000089094

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]  NM_001003953, NM_001005866, NM_013910
ラット [0]  

染色体

12q24.31  [121,866,902  -  122,018,920]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787  Zinc finger, PHD-finger
IPR001965  Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10799292
12477932
14702039
15302935
15489334
15520277
16362057
16943429
17463251
17672918
17704768
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19202064
19471022
20211142
20379614
20682791
21139048
21252908
21693764
22086844
22325352
22581228
22825849
23321669
23395003
24457600
24623842

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0048596  embryonic camera-type eye morphogenesis
GO:0030900  forebrain development
GO:0021592  fourth ventricle development
GO:0030902  hindbrain development
GO:0016577  histone demethylation
GO:0021993  initiation of neural tube closure
GO:0021670  lateral ventricle development
GO:0030901  midbrain development
GO:0021555  midbrain-hindbrain boundary morphogenesis
GO:0043524  negative regulation of neuron apoptosis
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0007283  spermatogenesis
GO:0021678  third ventricle development
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0031519  PcG protein complex

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0032452  histone demethylase activity
GO:0051864  histone demethylase activity (H3-K36 specific)
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0005515  protein binding
GO:0019843  rRNA binding
GO:0008270  zinc ion binding