synaptotagmin-like 1

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同義遺伝子名

Synaptotagmin-like protein 1, Exophilin-7, SYTL1, SLP1, FLJ14996, SB146, synaptotagmin-like 1, Protein JFC1, JFC1, exophilin-7

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:10.70 小脳:176.30 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:35.30 動脈:- 静脈:- リンパ節:182 末梢血:346.20 脾臓:548.30 胸腺:863.20 骨髄:118.10 脂肪:80.70 骨:51.20 皮膚:43.20
GeneChip nodata
CAGE 大脳:0.94 小脳:- 脳幹:0.64 脳梁:0.43 松果体:1.18 末梢神経:- 脊柱:0.32 網膜:- 目:- 動脈:2.61 静脈:3.98 リンパ節:3.68 末梢血:- 脾臓:3.05 胸腺:3.42 骨髄:- 脂肪:0.46 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.05 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.14 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:21.90 前立腺:383 卵巣:74.50 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:1371.30 胃:127.50 腸:129.60 結腸:33.90     肝臓:42.20        肺:117.30    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:97.80 乳腺:65.10 唾液腺:985.20
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.27 胎盤:1.90 前立腺:3.44 卵巣:1.61 精巣:0.89 心臓:0.63 骨格筋:0.38 食道:4.23 胃:- 腸:1.86 結腸:2.24     肝臓:0    肺:2.95 膀胱:2.37 腎臓:1.32 下垂体:2.71 甲状腺:2.16 副腎:- 膵臓:4.38 乳腺:2.34 唾液腺:4.26
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.36 卵巣:0.00 精巣:0.19 心臓:0.04 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.20     肝臓:0.07        肺:0.28    膀胱:- 腎臓:0.20 下垂体:- 甲状腺:0.14 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:0.14 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_032872
Gene ID 84958
Unigene ID Hs.469175
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000142765
GTEx ID ENSG00000142765

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_031393
ラット[1]  NM_001025651

染色体

1p36.11  [27,668,513  -  27,680,421]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000008  C2 calcium-dependent membrane targeting
IPR008973  C2 calcium/lipid-binding domain, CaLB
IPR018029  C2 membrane targeting protein
IPR010911  Rab-binding domain
IPR011011  Zinc finger, FYVE/PHD-type
IPR013083  Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
11243866
11278853
11773082
11980908
12137562
12477932
12590134
14702039
15489334
16004602
16344560
17200145
18266782
19528539
22438581
23082202
24285265

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006887  exocytosis
GO:0006886  intracellular protein transport

Cellular Component

GO:0019897  extrinsic to plasma membrane
GO:0042470  melanosome
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0042043  neurexin binding
GO:0005515  protein binding
GO:0017137  Rab GTPase binding