collagen, type XXVII, alpha 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

KIAA1870, FLJ11895, COL27A1, collagen, type XXVII, alpha 1, MGC11337, RP11-82I1.1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:16.60 小脳:50.40 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:122.70 脊柱:112.30 網膜:355.90 目:29.40 動脈:- 静脈:66.60 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:51.20 皮膚:19.20
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.07 小脳:- 脳幹:2.30 脳梁:1.76 松果体:1.60 末梢神経:- 脊柱:2.69 網膜:- 目:- 動脈:3.34 静脈:2.66 リンパ節:1.90 末梢血:- 脾臓:1.12 胸腺:1.62 骨髄:- 脂肪:2.15 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.21 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.59 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.32 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:45.60 胎盤:18.20 前立腺:78.90 卵巣:149.10 精巣:26 心臓:51.10 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17     肝臓:-        肺:44    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:50.80 膵臓:53.30 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:4.11 胎盤:2.19 前立腺:2.22 卵巣:3.13 精巣:1.52 心臓:2.03 骨格筋:1.58 食道:1.86 胃:- 腸:1.95 結腸:1.96     肝臓:2.08    肺:2.07 膀胱:2.43 腎臓:2.71 下垂体:1.30 甲状腺:2.12 副腎:- 膵臓:3.02 乳腺:2.11 唾液腺:0.83
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.82 卵巣:2.03 精巣:0.59 心臓:0.62 骨格筋:0.15 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.71     肝臓:1.01        肺:0.60    膀胱:- 腎臓:1.48 下垂体:- 甲状腺:1.74 副腎:2.04 膵臓:- 乳腺:0.51 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_032888
Gene ID 85301
Unigene ID Hs.494892
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000196739
GTEx ID ENSG00000196739

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_025685
ラット[1]  NM_198747

染色体

9q32  [116,917,840  -  117,074,791]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11347906
12477932
12714037
12766169
14702039
15922909
18391951
18978678
20379614
20467438
22889924
23192621

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030198  extracellular matrix organization

Cellular Component

GO:0005788  endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576  extracellular region
GO:0005583  fibrillar collagen

Molecular Function

GO:0005201  extracellular matrix structural constituent
GO:0046872  metal ion binding