chromobox homolog 4 (Pc class homolog, Drosophila)

同義遺伝子名

chromobox homolog 4 (Drosophila Pc class), chromobox homolog 4 (Pc class homolog, Drosophila), NBP16, Pc2, Chromobox protein homolog 4, hPC2, Polycomb 2 homolog, hPc2, CBX4

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:4.88

小脳:4.69

脳幹:4.82

脳梁:4.87

松果体:-

末梢神経:4.73

脊柱:4.84

網膜:-

目:-

動脈:4.63

静脈:4.43

リンパ節:5.02

末梢血:-

脾臓:5.10

胸腺:5.47

骨髄:5.11

脂肪:4.98

骨:-

皮膚:4.79

CAGE

大脳:3.80

小脳:-

脳幹:3.94

脳梁:4.24

松果体:4.16

末梢神経:-

脊柱:3.50

網膜:-

目:-

動脈:3.26

静脈:3.58

リンパ節:3.75

末梢血:-

脾臓:3.67

胸腺:4.41

骨髄:-

脂肪:2.63

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.08

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.36

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:4.50

胎盤:4.87

前立腺:4.77

卵巣:4.51

精巣:4.58

心臓:4.62

骨格筋:4.25

食道:5.25

胃:4.60

腸:4.44

結腸:4.61

肝臓:4.66

肺:4.57

膀胱:-

腎臓:4.66

下垂体:5.23

甲状腺:4.64

副腎:4.97

膵臓:4.79

乳腺:4.85

唾液腺:4.68

CAGE

子宮:2.92

胎盤:4.00

前立腺:3.19

卵巣:3.38

精巣:3.05

心臓:3.25

骨格筋:1.94

食道:3.47

胃:-

腸:2.93

結腸:2.89

肝臓:3.53

肺:3.41

膀胱:3.09

腎臓:3.05

下垂体:3.73

甲状腺:3.30

副腎:-

膵臓:3.71

乳腺:2.99

唾液腺:3.81

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.48

卵巣:2.73

精巣:2.21

心臓:1.72

骨格筋:0.95

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.87

肝臓:1.63

肺:3.00

膀胱:-

腎臓:2.38

下垂体:-

甲状腺:2.36

副腎:3.22

膵臓:-

乳腺:1.97

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003655
Gene ID	8535
Unigene ID	-
Probe set ID	206724_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000141582
GTEx ID	ENSG00000141582

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_007625
ラット[2]	NM_007625

染色体

17q25.3 [77,806,955 - 77,813,228]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953	Chromo domain
IPR017984	Chromo domain subgroup

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016568	chromatin modification
GO:0043066	negative regulation of apoptosis
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0016925	protein sumoylation
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005794	Golgi apparatus
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0031519	PcG protein complex
GO:0035102	PRC1 complex

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0019899	enzyme binding
GO:0016874	ligase activity
GO:0035064	methylated histone residue binding
GO:0051219	phosphoprotein binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003727	single-stranded RNA binding
GO:0032183	SUMO binding
GO:0003714	transcription corepressor activity

chromobox homolog 4 (Pc class homolog, Drosophila)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function