tripartite motif-containing 5

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同義遺伝子名

RNF88, Tripartite motif-containing protein 5, TRIM5alpha, TRIM5, tripartite motif-containing 5, RING finger protein 88

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:14.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:29.40

動脈:30

静脈:66.60

リンパ節:-

末梢血:36.40

脾臓:18.90

胸腺:141.70

骨髄:19.70

脂肪:40.30

骨:25.60

皮膚:33.60

GeneChip

大脳:3.20

小脳:3.35

脳幹:3.29

脳梁:3.19

松果体:-

末梢神経:4.22

脊柱:3.55

網膜:-

目:-

動脈:4.76

静脈:4.23

リンパ節:4.68

末梢血:-

脾臓:4.83

胸腺:6.04

骨髄:4.06

脂肪:4.10

骨:-

皮膚:4.08

CAGE

大脳:1.61

小脳:-

脳幹:2.00

脳梁:2.11

松果体:2.17

末梢神経:-

脊柱:2.58

網膜:-

目:-

動脈:3.20

静脈:3.13

リンパ節:2.81

末梢血:-

脾臓:3.35

胸腺:3.43

骨髄:-

脂肪:2.98

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.08

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.55

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.10

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:27.30

胎盤:21.90

前立腺:45.10

卵巣:-

精巣:-

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:21.20

腸:32.40

結腸:8.50

肝臓:42.20

肺:39.10

膀胱:125.60

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:8.90

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.25

胎盤:4.45

前立腺:5.53

卵巣:4.72

精巣:3.48

心臓:3.97

骨格筋:3.41

食道:4.28

胃:4.07

腸:4.07

結腸:3.77

肝臓:4.59

肺:4.83

膀胱:-

腎臓:3.97

下垂体:3.67

甲状腺:5.03

副腎:4.51

膵臓:4.58

乳腺:4.40

唾液腺:4.56

CAGE

子宮:3.17

胎盤:2.79

前立腺:2.94

卵巣:2.98

精巣:2.58

心臓:2.47

骨格筋:1.33

食道:2.92

胃:-

腸:2.95

結腸:2.50

肝臓:2.99

肺:3.27

膀胱:3.06

腎臓:3.07

下垂体:2.44

甲状腺:3.38

副腎:-

膵臓:3.54

乳腺:2.87

唾液腺:3.09

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.65

卵巣:0.03

精巣:0.09

心臓:0.08

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.25

肝臓:0.60

肺:0.23

膀胱:-

腎臓:0.05

下垂体:-

甲状腺:0.33

副腎:0.03

膵臓:-

乳腺:0.13

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_033093
Gene ID	85363
Unigene ID	Hs.370515
Probe set ID	210705_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000132256
GTEx ID	ENSG00000132256

オーソログ対応遺伝子

マウス[14]	NM_009099, NM_001146007, NM_175677, NM_001167828, NM_199146, NM_023835
ラット[1]	NM_001014023, NM_001146007, NM_175677, NM_001167828, NM_199146, NM_023835

染色体

11p15.4 [5,684,425 - 5,959,849]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001870	B302 (SPRY)-like
IPR003879	Butyrophylin-like
IPR003877	SPla/RYanodine receptor SPRY
IPR018355	SPla/RYanodine receptor subgroup
IPR000315	Zinc finger, B-box

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0002218	activation of innate immune response
GO:0051607	defense response to virus
GO:0045087	innate immune response
GO:0002221	pattern recognition receptor signaling pathway
GO:0043123	positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade
GO:0043410	positive regulation of MAPKKK cascade
GO:0051092	positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
GO:0070534	protein K63-linked ubiquitination
GO:0070206	protein trimerization
GO:0031664	regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway
GO:0019048	virus-host interaction

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0000932	cytoplasmic mRNA processing body
GO:0005794	Golgi apparatus
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0042802	identical protein binding
GO:0008329	pattern recognition receptor activity
GO:0005515	protein binding
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0004842	ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270	zinc ion binding

tripartite motif-containing 5

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function