BARX homeobox 2

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同義遺伝子名

MGC133369, Homeobox protein BarH-like 2, BarH-like homeobox 2, BARX2, MGC133368

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:5.90 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:19.20
GeneChip 大脳:5.44 小脳:5.98 脳幹:5.33 脳梁:5.62 松果体:- 末梢神経:5.39 脊柱:5.43 網膜:- 目:- 動脈:5.56 静脈:5.78 リンパ節:5.76 末梢血:- 脾臓:5.47 胸腺:5.41 骨髄:5.84 脂肪:5.51 骨:- 皮膚:5.99
CAGE 大脳:0.43 小脳:- 脳幹:0.63 脳梁:0.76 松果体:0.26 末梢神経:- 脊柱:1.19 網膜:- 目:- 動脈:1.72 静脈:0.70 リンパ節:2.18 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0.61 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.65 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.87 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.11 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:8.50     肝臓:10.60        肺:-    膀胱:125.60 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:46.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.46 胎盤:5.92 前立腺:5.21 卵巣:5.55 精巣:5.20 心臓:5.75 骨格筋:5.55 食道:6.83 胃:5.73 腸:5.84 結腸:5.81 肝臓:5.88 肺:5.77 膀胱:- 腎臓:5.71 下垂体:5.43 甲状腺:5.23 副腎:5.38 膵臓:5.52 乳腺:5.72 唾液腺:6.73
CAGE 子宮:2.01 胎盤:1.25 前立腺:1.19 卵巣:0.92 精巣:1.29 心臓:0.09 骨格筋:1.03 食道:4.66 胃:- 腸:2.51 結腸:1.66     肝臓:0    肺:0.39 膀胱:0.33 腎臓:1.48 下垂体:0.62 甲状腺:0.76 副腎:- 膵臓:2.48 乳腺:2.27 唾液腺:5.28
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.55 卵巣:1.35 精巣:2.65 心臓:0 骨格筋:0.01 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.08     肝臓:0        肺:0.64    膀胱:- 腎臓:2.06 下垂体:- 甲状腺:3.17 副腎:1.20 膵臓:- 乳腺:3.91 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003658
Gene ID 8538
Unigene ID Hs.591944
Probe set ID 210419_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000043039
GTEx ID ENSG00000043039

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_013800
ラット[1]  NM_013800

染色体

11q24.3  [129,245,835  -  129,322,171]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356  Homeobox
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9122247
10644443
10854790
11278942
12477932
14702039
14744868
20634891
21890473
22238593
22383897

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0001502  cartilage condensation
GO:0042637  catagen
GO:0014902  myotube differentiation
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005667  transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity