endothelial differentiation-related factor 1

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同義遺伝子名

EDF-1, endothelial differentiation-related factor 1, Endothelial differentiation-related factor 1, EDF1, MBF1, Multiprotein-bridging factor 1, MGC9058

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:59.30 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:99.90 動脈:89.90 静脈:266.60 リンパ節:91 末梢血:18.20 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:59 脂肪:- 骨:- 皮膚:72
GeneChip 大脳:8.62 小脳:8.55 脳幹:8.86 脳梁:8.46 松果体:- 末梢神経:8.74 脊柱:8.36 網膜:- 目:- 動脈:9.21 静脈:8.71 リンパ節:9.07 末梢血:- 脾臓:8.77 胸腺:8.81 骨髄:8.14 脂肪:8.55 骨:- 皮膚:9.13
CAGE 大脳:5.66 小脳:- 脳幹:5.31 脳梁:5.21 松果体:5.37 末梢神経:- 脊柱:5.81 網膜:- 目:- 動脈:6.10 静脈:5.99 リンパ節:5.77 末梢血:- 脾臓:5.38 胸腺:5.25 骨髄:- 脂肪:5.38 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:7.30 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:7.24 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:7.49 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:21.90 前立腺:236.60 卵巣:186.30 精巣:13 心臓:140.50 骨格筋:221 食道:- 胃:21.20 腸:32.40 結腸:50.90     肝臓:73.90        肺:44    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:- 膵臓:151.10 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.91 胎盤:8.33 前立腺:9.35 卵巣:9.12 精巣:8.43 心臓:8.58 骨格筋:8.38 食道:9.15 胃:8.82 腸:8.75 結腸:8.77 肝臓:9.27 肺:8.79 膀胱:- 腎臓:9.02 下垂体:9.05 甲状腺:9.35 副腎:8.99 膵臓:9.29 乳腺:9.05 唾液腺:9.57
CAGE 子宮:5.72 胎盤:5.41 前立腺:5.63 卵巣:5.73 精巣:5.47 心臓:5.95 骨格筋:6.39 食道:5.74 胃:- 腸:6.17 結腸:5.91     肝臓:6.14    肺:5.63 膀胱:5.64 腎臓:5.71 下垂体:5.57 甲状腺:5.65 副腎:- 膵臓:7.16 乳腺:5.99 唾液腺:6.61
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:7.96 卵巣:7.89 精巣:7.82 心臓:6.27 骨格筋:7.16 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:7.67     肝臓:7.35        肺:7.44    膀胱:- 腎臓:7.45 下垂体:- 甲状腺:7.79 副腎:7.73 膵臓:- 乳腺:7.56 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003792
Gene ID 8721
Unigene ID Hs.174050
Probe set ID 209058_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000107223
GTEx ID ENSG00000107223

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_021519
ラット[1]  NM_001106557

染色体

9q34.3  [139,756,571  -  139,760,738]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001387  Helix-turn-helix type 3
IPR010982  Lambda repressor-like, DNA-binding

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7566098
8164657
9813014
10469174
10567391
10816571
12040021
12477932
15112053
15164053
15489334
16567061
16880509
17709345
18029348
20972266
21139048
21782027
21890473
21900206
21906983
22939629
23000965
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0045446  endothelial cell differentiation
GO:0007275  multicellular organismal development
GO:0043388  positive regulation of DNA binding
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0019216  regulation of lipid metabolic process
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005622  intracellular
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0005669  transcription factor TFIID complex

Molecular Function

GO:0005516  calmodulin binding
GO:0004402  histone acetyltransferase activity
GO:0008168  methyltransferase activity
GO:0005515  protein binding
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003713  transcription coactivator activity
GO:0003700  transcription factor activity