catenin (cadherin-associated protein), alpha-like 1

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同義遺伝子名

alpha-CATU, Alpha-catenin-related protein, ACRP, Catenin alpha-like protein 1, CTNNAL1, CLLP, Alpha-catulin

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:148.10 小脳:201.50 脳幹:- 脳梁:58.30 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:224.60 網膜:118.60 目:58.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.10 末梢血:18.20 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:25.60 皮膚:24
GeneChip 大脳:5.41 小脳:5.24 脳幹:4.95 脳梁:5.19 松果体:- 末梢神経:8.54 脊柱:5.86 網膜:- 目:- 動脈:7.31 静脈:7.53 リンパ節:6.42 末梢血:- 脾臓:6.76 胸腺:6.59 骨髄:6.63 脂肪:7.26 骨:- 皮膚:6.48
CAGE 大脳:2.64 小脳:- 脳幹:2.50 脳梁:1.91 松果体:3.78 末梢神経:- 脊柱:3.12 網膜:- 目:- 動脈:3.79 静脈:3.23 リンパ節:2.58 末梢血:- 脾臓:3.26 胸腺:2.98 骨髄:- 脂肪:3.34 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.78 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.98 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.89 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:18.20 前立腺:67.60 卵巣:74.50 精巣:38.90 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:8.50     肝臓:31.70        肺:19.60    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:101.60 膵臓:17.80 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.37 胎盤:7.13 前立腺:7.20 卵巣:8.59 精巣:7.99 心臓:7.77 骨格筋:6.85 食道:6.50 胃:7.09 腸:6.80 結腸:5.94 肝臓:6.63 肺:8.26 膀胱:- 腎臓:6.93 下垂体:6.49 甲状腺:8.65 副腎:9.61 膵臓:6.53 乳腺:6.63 唾液腺:6.43
CAGE 子宮:3.45 胎盤:3.57 前立腺:3.45 卵巣:4.77 精巣:4.03 心臓:4.49 骨格筋:3.77 食道:3.61 胃:- 腸:2.60 結腸:2.92     肝臓:3.61    肺:4.27 膀胱:3.80 腎臓:3.76 下垂体:3.03 甲状腺:4.88 副腎:- 膵臓:3.29 乳腺:3.95 唾液腺:2.60
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.12 卵巣:6.47 精巣:5.08 心臓:4.38 骨格筋:4.49 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:4.13     肝臓:3.26        肺:6.09    膀胱:- 腎臓:4.86 下垂体:- 甲状腺:6.98 副腎:3.70 膵臓:- 乳腺:4.55 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003798
Gene ID 8727
Unigene ID Hs.584880
Probe set ID 202468_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000119326
GTEx ID ENSG00000119326

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_018761
ラット[1]  NM_001106649

染色体

9q31.3  [111,704,851  -  111,775,809]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001033  Alpha-catenin
IPR006077  Vinculin/alpha-catenin

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8125298
9806841
10542337
11768226
12270917
12477932
12694354
14690447
14702039
14993280
15164053
15489334
17647259
17952117
18374411
20677014
20696764
21115837
21139048
21278790
21906983
21988832
22359570
22648798
22733455
23000965
23047866

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007155  cell adhesion
GO:0007266  Rho protein signal transduction

Cellular Component

GO:0015629  actin cytoskeleton
GO:0005829  cytosol
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0045296  cadherin binding
GO:0005198  structural molecule activity