actinin, alpha 2

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同義遺伝子名

ACTN2, Alpha actinin skeletal muscle isoform 2, actinin, alpha 2, Alpha-actinin-2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:49.80

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:-

目:17.60

動脈:30

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:18.20

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:524.30

骨:-

皮膚:139.20

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:3.76

小脳:-

脳幹:4.42

脳梁:4.42

松果体:1.90

末梢神経:-

脊柱:3.78

網膜:-

目:-

動脈:3.85

静脈:4.25

リンパ節:2.16

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0.23

骨髄:-

脂肪:4.11

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

nodata

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:33.80

卵巣:-

精巣:21.60

心臓:842.90

骨格筋:1346.10

食道:-

胃:-

腸:32.40

結腸:-

肝臓:52.80

肺:53.80

膀胱:-

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:0.55

胎盤:0.08

前立腺:1.85

卵巣:0.52

精巣:2.29

心臓:7.30

骨格筋:8.25

食道:4.07

胃:-

腸:0.90

結腸:0.08

肝臓:0.14

肺:1.63

膀胱:2.62

腎臓:0.08

下垂体:0.50

甲状腺:3.99

副腎:-

膵臓:1.87

乳腺:0.90

唾液腺:2.78

RNA-seq

nodata

IDs

Refseq ID	NM_001103000
Gene ID	88
Unigene ID	Hs.498178
Probe set ID	-
Ensembl ID	-
GTEx ID	-

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]
ラット [0]

染色体

1q43 [236,849,754 - 236,927,931]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002048	Calcium-binding EF-hand
IPR016146	Calponin-homology
IPR001715	Calponin-like actin-binding
IPR018249	EF-HAND 2
IPR018159	Spectrin/alpha-actinin

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0051764	actin crosslink formation
GO:0051017	actin filament bundle formation
GO:0007596	blood coagulation
GO:0007155	cell adhesion
GO:0048041	focal adhesion formation
GO:0030035	microspike assembly
GO:0030049	muscle filament sliding
GO:0043267	negative regulation of potassium ion transport
GO:0030168	platelet activation
GO:0002576	platelet degranulation
GO:0043268	positive regulation of potassium ion transport
GO:0051289	protein homotetramerization
GO:0042981	regulation of apoptosis
GO:0042391	regulation of membrane potential
GO:0007268	synaptic transmission

Cellular Component

GO:0005884	actin filament
GO:0005856	cytoskeleton
GO:0005829	cytosol
GO:0043197	dendritic spine
GO:0005576	extracellular region
GO:0030175	filopodium
GO:0005925	focal adhesion
GO:0031093	platelet alpha granule lumen
GO:0031143	pseudopodium
GO:0030018	Z disc

Molecular Function

GO:0051015	actin filament binding
GO:0005509	calcium ion binding
GO:0008092	cytoskeletal protein binding
GO:0051373	FATZ binding
GO:0042802	identical protein binding
GO:0005178	integrin binding
GO:0030274	LIM domain binding
GO:0005515	protein binding
GO:0046983	protein dimerization activity
GO:0008307	structural constituent of muscle
GO:0030375	thyroid hormone receptor coactivator activity
GO:0031432	titin binding
GO:0070080	titin Z domain binding

actinin, alpha 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

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遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function