synaptic Ras GTPase activating protein 1 homolog (rat)

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同義遺伝子名

SYNGAP1, Ras GTPase-activating protein SynGAP, RASA5, Synaptic Ras-GTPase-activating protein 1, DKFZp761G1421, Synaptic Ras-GAP 1, RASA1, Neuronal RasGAP, KIAA1938, SYNGAP

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:16.60 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:29.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.10 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:25.80 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:4.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:4.23 小脳:- 脳幹:2.98 脳梁:2.85 松果体:4.33 末梢神経:- 脊柱:3.60 網膜:- 目:- 動脈:2.84 静脈:2.16 リンパ節:2.12 末梢血:- 脾臓:2.12 胸腺:3.20 骨髄:- 脂肪:1.07 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:10.90 前立腺:11.30 卵巣:37.30 精巣:4.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17     肝臓:-        肺:9.80    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:44.50 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.90 胎盤:0.92 前立腺:2.32 卵巣:3.01 精巣:2.09 心臓:1.61 骨格筋:1.46 食道:1.80 胃:- 腸:1.07 結腸:2.10     肝臓:0.78    肺:1.99 膀胱:2.36 腎臓:1.14 下垂体:4.32 甲状腺:1.13 副腎:- 膵臓:0.94 乳腺:2.64 唾液腺:1.00
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0 卵巣:0 精巣:0 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0 膵臓:- 乳腺:0 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006772
Gene ID 8831
Unigene ID Hs.586264
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000197283
GTEx ID ENSG00000197283

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]  
ラット[4]  NM_001113409, NM_181092

染色体

6p21.32  [33,387,847  -  33,421,466]
HSCHR6_MHC_SSTO  [33,527,235  -  33,560,852]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000008  C2 calcium-dependent membrane targeting
IPR008973  C2 calcium/lipid-binding domain, CaLB
IPR001849  Pleckstrin homology
IPR001936  Ras GTPase-activating protein
IPR008936  Rho GTPase activation protein

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1374684
9405464
9581761
9620694
10862698
11278737
11487731
11572484
11782456
12598599
12951199
14574404
14702039
14970204
15014045
15044063
15146197
15312654
15358237
16344560
18323856
19196676
19483657
19851445
20188038
20531469
20683986
21237447
21480541
22939629
23161826
23708187

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016358  dendrite development
GO:0043066  negative regulation of apoptosis
GO:0050771  negative regulation of axonogenesis
GO:0046580  negative regulation of Ras protein signal transduction
GO:0007389  pattern specification process
GO:0032320  positive regulation of Ras GTPase activity
GO:0007265  Ras protein signal transduction
GO:0043113  receptor clustering
GO:0048169  regulation of long-term neuronal synaptic plasticity
GO:0043408  regulation of MAPKKK cascade
GO:0050803  regulation of synapse structure and activity
GO:0048167  regulation of synaptic plasticity
GO:0008542  visual learning

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0043198  dendritic shaft
GO:0031235  intrinsic to internal side of plasma membrane

Molecular Function

GO:0005543  phospholipid binding
GO:0005097  Rab GTPase activator activity
GO:0005099  Ras GTPase activator activity
GO:0017124  SH3 domain binding