histone deacetylase 3

詳細情報を見る

同義遺伝子名

histone deacetylase 3, HD3, SMAP45, RPD3-2, Histone deacetylase 3, HDAC3

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:26.10

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:112.30

網膜:-

目:76.40

動脈:-

静脈:-

リンパ節:111.20

末梢血:91.10

脾臓:18.90

胸腺:12.90

骨髄:59

脂肪:40.30

骨:-

皮膚:86.40

GeneChip

大脳:6.69

小脳:6.93

脳幹:6.67

脳梁:6.60

松果体:-

末梢神経:7.02

脊柱:6.71

網膜:-

目:-

動脈:7.24

静脈:6.97

リンパ節:7.48

末梢血:-

脾臓:7.41

胸腺:7.33

骨髄:7.47

脂肪:7.21

骨:-

皮膚:7.62

CAGE

大脳:2.10

小脳:-

脳幹:2.12

脳梁:2.02

松果体:1.75

末梢神経:-

脊柱:2.06

網膜:-

目:-

動脈:2.85

静脈:2.42

リンパ節:2.76

末梢血:-

脾臓:2.01

胸腺:2.29

骨髄:-

脂肪:2.03

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.30

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.14

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.74

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:54.70

胎盤:65.60

前立腺:56.30

卵巣:186.30

精巣:56.20

心臓:51.10

骨格筋:40.20

食道:-

胃:148.70

腸:-

結腸:93.30

肝臓:52.80

肺:78.20

膀胱:-

腎臓:72.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:88.90

乳腺:55.80

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.30

胎盤:7.26

前立腺:7.37

卵巣:7.32

精巣:7.08

心臓:6.97

骨格筋:7.15

食道:7.46

胃:7.23

腸:7.11

結腸:7.18

肝臓:7.34

肺:7.13

膀胱:-

腎臓:7.36

下垂体:7.29

甲状腺:7.48

副腎:7.50

膵臓:7.16

乳腺:7.57

唾液腺:7.19

CAGE

子宮:1.94

胎盤:2.27

前立腺:2.15

卵巣:2.19

精巣:2.27

心臓:2.40

骨格筋:1.92

食道:2.24

胃:-

腸:1.87

結腸:2.49

肝臓:2.24

肺:2.51

膀胱:2.08

腎臓:1.94

下垂体:1.94

甲状腺:2.17

副腎:-

膵臓:2.71

乳腺:2.69

唾液腺:2.17

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.29

卵巣:4.26

精巣:4.01

心臓:3.54

骨格筋:3.86

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.90

肝臓:3.64

肺:3.52

膀胱:-

腎臓:3.95

下垂体:-

甲状腺:4.28

副腎:4.15

膵臓:-

乳腺:3.83

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003883
Gene ID	8841
Unigene ID	Hs.519632
Probe set ID	216326_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000171720
GTEx ID	ENSG00000171720

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_010411
ラット[1]	NM_053448

染色体

5q31.3 [141,000,443 - 141,016,437]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003084	Histone deacetylase
IPR000286	Histone deacetylase superfamily

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0044255	cellular lipid metabolic process
GO:0016568	chromatin modification
GO:0032922	circadian regulation of gene expression
GO:0043066	negative regulation of apoptosis
GO:0045786	negative regulation of cell cycle
GO:0046329	negative regulation of JNK cascade
GO:0010832	negative regulation of myotube differentiation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0048011	nerve growth factor receptor signaling pathway
GO:0007219	Notch signaling pathway
GO:0006476	protein amino acid deacetylation
GO:0007346	regulation of mitotic cell cycle
GO:0040014	regulation of multicellular organism growth
GO:0051225	spindle assembly
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0000118	histone deacetylase complex
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005876	spindle microtubule
GO:0017053	transcriptional repressor complex

Molecular Function

GO:0031490	chromatin DNA binding
GO:0019899	enzyme binding
GO:0004407	histone deacetylase activity
GO:0042826	histone deacetylase binding
GO:0032041	NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
GO:0046969	NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific)
GO:0046970	NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific)
GO:0005515	protein binding
GO:0033558	protein deacetylase activity
GO:0003714	transcription corepressor activity
GO:0008134	transcription factor binding

histone deacetylase 3

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function