methyl-CpG binding domain protein 4

同義遺伝子名

Mismatch-specific DNA N-glycosylase, MED1, Methyl-CpG-binding domain protein 4, MBD4, methyl-CpG binding domain protein 4, Methyl-CpG-binding endonuclease 1, Methyl-CpG-binding protein MBD4

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:85.30

小脳:100.80

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:112.30

網膜:-

目:94

動脈:89.90

静脈:-

リンパ節:242.60

末梢血:109.30

脾臓:170.20

胸腺:206.10

骨髄:59

脂肪:80.70

骨:102.40

皮膚:91.20

GeneChip

大脳:7.03

小脳:7.41

脳幹:6.78

脳梁:7.42

松果体:-

末梢神経:7.16

脊柱:6.87

網膜:-

目:-

動脈:7.22

静脈:7.01

リンパ節:8.82

末梢血:-

脾臓:9.20

胸腺:8.78

骨髄:8.31

脂肪:7.22

骨:-

皮膚:7.36

CAGE

大脳:3.23

小脳:-

脳幹:3.30

脳梁:3.21

松果体:3.44

末梢神経:-

脊柱:3.33

網膜:-

目:-

動脈:2.88

静脈:3.90

リンパ節:3.96

末梢血:-

脾臓:4.01

胸腺:3.73

骨髄:-

脂肪:3.46

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.28

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.03

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.33

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:127.60

胎盤:51

前立腺:135.20

卵巣:74.50

精巣:138.40

心臓:114.90

骨格筋:20.10

食道:-

胃:63.70

腸:259.20

結腸:110.20

肝臓:52.80

肺:171.10

膀胱:-

腎臓:114.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:168.90

乳腺:27.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.80

胎盤:7.18

前立腺:7.63

卵巣:7.97

精巣:7.40

心臓:7.43

骨格筋:6.92

食道:7.56

胃:8.18

腸:7.29

結腸:7.31

肝臓:8.28

肺:7.93

膀胱:-

腎臓:7.54

下垂体:7.47

甲状腺:7.71

副腎:7.89

膵臓:7.09

乳腺:7.81

唾液腺:6.86

CAGE

子宮:3.25

胎盤:3.31

前立腺:3.22

卵巣:3.52

精巣:2.89

心臓:3.51

骨格筋:3.28

食道:3.10

胃:-

腸:3.49

結腸:3.25

肝臓:3.71

肺:3.55

膀胱:3.36

腎臓:3.66

下垂体:3.61

甲状腺:3.17

副腎:-

膵臓:3.06

乳腺:3.66

唾液腺:2.75

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.62

卵巣:4.37

精巣:3.90

心臓:2.98

骨格筋:2.82

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.17

肝臓:3.54

肺:3.10

膀胱:-

腎臓:4.15

下垂体:-

甲状腺:3.76

副腎:4.30

膵臓:-

乳腺:3.34

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003925
Gene ID	8930
Unigene ID	Hs.35947
Probe set ID	209579_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000129071
GTEx ID	ENSG00000129071

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_010774
ラット[1]	NM_010774

染色体

3q21.3 [129,149,787 - 129,158,878]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR016177	DNA-binding, integrase-type
IPR001739	Methyl-CpG DNA binding

GO:0006284	base-excision repair
GO:0006285	base-excision repair, AP site formation
GO:0045008	depyrimidination
GO:0008630	DNA damage response, signal transduction resulting in induction of apoptosis
GO:0006281	DNA repair
GO:0031572	G2/M transition DNA damage checkpoint
GO:0009314	response to radiation

GO:0000785	chromatin
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

GO:0004520	endodeoxyribonuclease activity
GO:0005515	protein binding
GO:0008263	pyrimidine-specific mismatch base pair DNA N-glycosylase activity
GO:0003696	satellite DNA binding

methyl-CpG binding domain protein 4

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function