FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3

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同義遺伝子名

FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3, FLJ00004, FGD3, Zinc finger FYVE domain-containing protein 5, MGC117260, ZFYVE5

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:19 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:76.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:91 末梢血:127.50 脾臓:170.20 胸腺:77.30 骨髄:373.90 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE 大脳:1.06 小脳:- 脳幹:1.71 脳梁:1.89 松果体:0.47 末梢神経:- 脊柱:2.04 網膜:- 目:- 動脈:1.82 静脈:3.72 リンパ節:3.87 末梢血:- 脾臓:3.32 胸腺:4.23 骨髄:- 脂肪:1.66 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:47.40 前立腺:- 卵巣:74.50 精巣:13 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:59.40     肝臓:10.60        肺:44    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:- 乳腺:46.50 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:1.69 胎盤:1.76 前立腺:1.96 卵巣:1.16 精巣:1.03 心臓:1.46 骨格筋:0.49 食道:1.80 胃:- 腸:1.89 結腸:2.04     肝臓:0.78    肺:2.74 膀胱:1.96 腎臓:1.57 下垂体:0.72 甲状腺:1.75 副腎:- 膵臓:1.74 乳腺:2.02 唾液腺:1.75
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.43 卵巣:0.00 精巣:0.00 心臓:0.10 骨格筋:0.13 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.26 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001083536
Gene ID 89846
Unigene ID Hs.411081
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000127084
GTEx ID ENSG00000127084

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_015759
ラット[1]  NM_001108409

染色体

9q22.31  [95,709,733  -  95,798,518]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001849  Pleckstrin homology
IPR000306  Zinc finger, FYVE-type
IPR011011  Zinc finger, FYVE/PHD-type
IPR013083  Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8125298
10721717
11214971
11756498
12376548
12477932
12787561
14702039
15164053
15489334
16344560
17564959
18363964
20379614

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030036  actin cytoskeleton organization
GO:0007010  cytoskeleton organization
GO:0046847  filopodium assembly
GO:0048011  nerve growth factor receptor signaling pathway
GO:0043065  positive regulation of apoptosis
GO:0043088  regulation of Cdc42 GTPase activity
GO:0008360  regulation of cell shape
GO:0051056  regulation of small GTPase mediated signal transduction
GO:0007264  small GTPase mediated signal transduction

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0005829  cytosol
GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0030027  lamellipodium
GO:0001726  ruffle

Molecular Function

GO:0005085  guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0005543  phospholipid binding
GO:0005089  Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0031267  small GTPase binding