ATG16 autophagy related 16-like 2 (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

ATG16 autophagy related 16-like 2 (S. cerevisiae), FLJ00012, ATG16L2, WDR80

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 大脳:1.96 小脳:- 脳幹:2.12 脳梁:2.38 松果体:1.92 末梢神経:- 脊柱:2.08 網膜:- 目:- 動脈:2.45 静脈:2.79 リンパ節:2.81 末梢血:- 脾臓:2.94 胸腺:1.29 骨髄:- 脂肪:2.07 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.79 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.06 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.28 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.41 胎盤:1.59 前立腺:2.09 卵巣:2.07 精巣:1.41 心臓:1.82 骨格筋:1.26 食道:2.32 胃:- 腸:2.23 結腸:2.61     肝臓:1.41    肺:2.83 膀胱:1.88 腎臓:1.37 下垂体:2.29 甲状腺:1.62 副腎:- 膵臓:1.87 乳腺:2.11 唾液腺:1.75
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.16 卵巣:1.88 精巣:1.03 心臓:0.66 骨格筋:0.20 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.74     肝臓:0.83        肺:2.73    膀胱:- 腎臓:1.04 下垂体:- 甲状腺:1.71 副腎:2.76 膵臓:- 乳腺:1.28 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_033388
Gene ID 89849
Unigene ID -
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000168010
GTEx ID ENSG00000168010

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001111111
ラット [0]  

染色体

11q13.4  [72,525,353  -  72,554,719]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472  G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11214971
12477932
14702039
18187620
21900206
23266558
23439083
23563314
23850713

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006914  autophagy
GO:0015031  protein transport

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm