TATA box binding protein (TBP)-associated factor, RNA polymerase I, A, 48kDa

同義遺伝子名

TATA box-binding protein-associated factor 1A, RAFI48, TBP-associated factor RNA polymerase I 48 kDa, Transcription factor SL1, MGC:17061, TAFI48, TAF1A

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:8.30

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:30.30

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:9.60

GeneChip

大脳:3.34

小脳:3.41

脳幹:3.35

脳梁:3.61

松果体:-

末梢神経:3.60

脊柱:3.48

網膜:-

目:-

動脈:3.31

静脈:3.32

リンパ節:3.86

末梢血:-

脾臓:4.06

胸腺:4.45

骨髄:3.65

脂肪:3.37

骨:-

皮膚:3.39

CAGE

大脳:1.65

小脳:-

脳幹:1.85

脳梁:1.96

松果体:2.02

末梢神経:-

脊柱:1.80

網膜:-

目:-

動脈:1.85

静脈:1.73

リンパ節:1.80

末梢血:-

脾臓:1.95

胸腺:1.58

骨髄:-

脂肪:1.66

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.02

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.61

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.92

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:10.90

前立腺:-

卵巣:-

精巣:8.70

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:9.80

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.96

胎盤:3.47

前立腺:3.85

卵巣:4.15

精巣:4.50

心臓:3.28

骨格筋:3.09

食道:3.23

胃:3.46

腸:3.21

結腸:3.12

肝臓:3.08

肺:3.42

膀胱:-

腎臓:3.04

下垂体:3.53

甲状腺:3.79

副腎:3.25

膵臓:3.04

乳腺:3.61

唾液腺:2.99

CAGE

子宮:1.85

胎盤:1.71

前立腺:1.78

卵巣:2.08

精巣:2.15

心臓:1.34

骨格筋:0.75

食道:1.62

胃:-

腸:1.44

結腸:1.30

肝臓:1.60

肺:1.32

膀胱:1.62

腎臓:1.19

下垂体:2.54

甲状腺:2.01

副腎:-

膵臓:1.21

乳腺:1.16

唾液腺:1.28

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.55

卵巣:2.18

精巣:2.61

心臓:0.57

骨格筋:0.17

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.62

肝臓:0.74

肺:1.24

膀胱:-

腎臓:1.32

下垂体:-

甲状腺:0.65

副腎:1.11

膵臓:-

乳腺:1.01

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005681
Gene ID	9015
Unigene ID	Hs.153088
Probe set ID	206613_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000143498
GTEx ID	ENSG00000143498

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_021466
ラット[1]	NM_021466

染色体

1q41 [222,731,244 - 222,763,275]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0010467	gene expression
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006362	RNA elongation from RNA polymerase I promoter
GO:0006363	termination of RNA polymerase I transcription
GO:0006360	transcription from RNA polymerase I promoter
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006361	transcription initiation from RNA polymerase I promoter

GO:0005654	nucleoplasm
GO:0000120	RNA polymerase I transcription factor complex

TATA box binding protein (TBP)-associated factor, RNA polymerase I, A, 48kDa

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function