synaptogyrin 1

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同義遺伝子名

synaptogyrin 1, SYNGR1, Synaptogyrin-1, MGC:1939

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:142.20 小脳:226.70 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:224.60 網膜:118.60 目:164.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:18.20 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:59 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:33.60
GeneChip 大脳:5.16 小脳:5.15 脳幹:5.11 脳梁:5.38 松果体:- 末梢神経:6.55 脊柱:5.29 網膜:- 目:- 動脈:6.03 静脈:6.18 リンパ節:5.85 末梢血:- 脾臓:5.54 胸腺:5.14 骨髄:7.42 脂肪:5.60 骨:- 皮膚:6.61
CAGE 大脳:0.71 小脳:- 脳幹:0.58 脳梁:0.43 松果体:1.32 末梢神経:- 脊柱:0.52 網膜:- 目:- 動脈:0.34 静脈:0.47 リンパ節:0.15 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:0.26 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.09 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:32.80 前立腺:78.90 卵巣:37.30 精巣:38.90 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:42.20        肺:9.80    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.29 胎盤:5.92 前立腺:5.92 卵巣:6.28 精巣:6.89 心臓:6.80 骨格筋:6.44 食道:7.15 胃:5.60 腸:6.15 結腸:5.67 肝臓:5.13 肺:5.51 膀胱:- 腎臓:6.16 下垂体:4.82 甲状腺:5.56 副腎:6.51 膵臓:5.85 乳腺:6.25 唾液腺:7.27
CAGE 子宮:0.30 胎盤:0.48 前立腺:0.33 卵巣:0.20 精巣:0.07 心臓:0.42 骨格筋:0 食道:0.40 胃:- 腸:0 結腸:0.39     肝臓:0    肺:0.14 膀胱:0.33 腎臓:0.39 下垂体:0.10 甲状腺:0 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0.55 唾液腺:0.62
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.00 精巣:0.00 心臓:0.00 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0.62    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_145738
Gene ID 9145
Unigene ID Hs.216226
Probe set ID 210613_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000100321
GTEx ID ENSG00000100321

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]  NM_009303, NM_207708
ラット [0]  

染色体

22q13.1  [39,745,930  -  39,781,593]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008253  Marvel
IPR021128  MARVEL-like domain
IPR016579  Synaptogyrin

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9760194
10591208
10595519
11086983
12477932
14732601
15461802
15489334
16215643
16344560
17049558
17081065
19641478
19665806
21139048
21890473
22505724
22675529
23000965
23382691

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006605  protein targeting
GO:0048169  regulation of long-term neuronal synaptic plasticity
GO:0048172  regulation of short-term neuronal synaptic plasticity

Cellular Component

GO:0030054  cell junction
GO:0016021  integral to membrane
GO:0042470  melanosome
GO:0030672  synaptic vesicle membrane