collagen, type XXIII, alpha 1

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同義遺伝子名

collagen, type XXIII, alpha 1, Collagen alpha-1(XXIII) chain, DKFZp434K0621, COL23A1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 大脳:0.80 小脳:- 脳幹:0.37 脳梁:0.24 松果体:0.74 末梢神経:- 脊柱:0.89 網膜:- 目:- 動脈:1.03 静脈:1.29 リンパ節:0.79 末梢血:- 脾臓:0.84 胸腺:0.23 骨髄:- 脂肪:0.14 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.54 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.53 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.14 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 子宮:0.88 胎盤:0.16 前立腺:1.38 卵巣:0.20 精巣:1.51 心臓:1.91 骨格筋:0.55 食道:0.46 胃:- 腸:1.56 結腸:0.60     肝臓:0.78    肺:0.93 膀胱:0.69 腎臓:1.03 下垂体:0.40 甲状腺:3.71 副腎:- 膵臓:0.94 乳腺:0.90 唾液腺:0.62
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.64 卵巣:0.12 精巣:0.59 心臓:1.96 骨格筋:0.09 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.52     肝臓:0.12        肺:1.21    膀胱:- 腎臓:0.97 下垂体:- 甲状腺:3.97 副腎:0.83 膵臓:- 乳腺:0.15 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_173465
Gene ID 91522
Unigene ID -
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000050767
GTEx ID ENSG00000050767

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_153393
ラット[1]  NM_181636

染色体

5q35.3  [177,664,619  -  178,017,556]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

12477932
12644459
15231747
15489334
16728390
17627939
19724895
19851296
20198315
20379614
20447926
21652699
23251661
23568457

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030574  collagen catabolic process
GO:0022617  extracellular matrix disassembly
GO:0030198  extracellular matrix organization

Cellular Component

GO:0005581  collagen
GO:0005788  endoplasmic reticulum lumen
GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane