dehydrogenase/reductase (SDR family) member 3

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同義遺伝子名

dehydrogenase/reductase (SDR family) member 3, Short-chain dehydrogenase/reductase 3, DD83.1, SDR1, Retinal short-chain dehydrogenase/reductase 1, DHRS3, Rsdr1, UNQ2424/PRO4983, retSDR1, RDH17

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:22.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:58.30 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:237.30 目:82.30 動脈:209.80 静脈:66.60 リンパ節:30.30 末梢血:54.70 脾臓:18.90 胸腺:25.80 骨髄:39.40 脂肪:322.70 骨:25.60 皮膚:76.80
GeneChip 大脳:7.12 小脳:6.10 脳幹:7.17 脳梁:7.17 松果体:- 末梢神経:8.26 脊柱:7.59 網膜:- 目:- 動脈:8.47 静脈:8.38 リンパ節:7.67 末梢血:- 脾臓:6.96 胸腺:6.89 骨髄:6.93 脂肪:9.08 骨:- 皮膚:8.28
CAGE 大脳:3.10 小脳:- 脳幹:2.98 脳梁:3.34 松果体:3.01 末梢神経:- 脊柱:3.91 網膜:- 目:- 動脈:5.12 静脈:4.85 リンパ節:3.74 末梢血:- 脾臓:3.09 胸腺:2.81 骨髄:- 脂肪:5.21 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.22 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:5.02 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:6.19 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:63.80 胎盤:47.40 前立腺:349.20 卵巣:- 精巣:8.70 心臓:51.10 骨格筋:20.10 食道:1028.50 胃:85 腸:64.80 結腸:178.10     肝臓:116.10        肺:88    膀胱:125.60 腎臓:166.40 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:65.10 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.79 胎盤:7.60 前立腺:9.10 卵巣:8.43 精巣:7.04 心臓:8.28 骨格筋:7.66 食道:8.21 胃:8.06 腸:8.07 結腸:8.01 肝臓:9.40 肺:7.90 膀胱:- 腎臓:8.33 下垂体:7.52 甲状腺:8.65 副腎:7.69 膵臓:7.75 乳腺:8.27 唾液腺:8.35
CAGE 子宮:4.41 胎盤:4.36 前立腺:4.82 卵巣:4.41 精巣:3.49 心臓:4.32 骨格筋:3.93 食道:4.85 胃:- 腸:4.57 結腸:4.37     肝臓:5.42    肺:4.46 膀胱:4.96 腎臓:4.30 下垂体:3.21 甲状腺:5.65 副腎:- 膵臓:4.60 乳腺:5.47 唾液腺:4.35
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:5.78 卵巣:5.06 精巣:4.28 心臓:4.02 骨格筋:4.22 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:4.77     肝臓:6.33        肺:5.40    膀胱:- 腎臓:4.92 下垂体:- 甲状腺:6.38 副腎:4.27 膵臓:- 乳腺:5.93 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_004753
Gene ID 9249
Unigene ID Hs.289347
Probe set ID 202481_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000162496
GTEx ID ENSG00000162496

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001172424, NM_011303
ラット[1]  NM_001037199, NM_011303

染色体

1p36.22  [12,627,939  -  12,677,737]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002347  Glucose/ribitol dehydrogenase
IPR016040  NAD(P)-binding domain
IPR020842  Polyketide synthase/Fatty acid synthase, KR
IPR002198  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8125298
9705317
10800688
11861404
12226107
12477932
12975309
15489334
16710414
17286855
18676742
19027726
19322201
20379614
20543567
21659514
21890473
21906983
21963094

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007603  phototransduction, visible light
GO:0001523  retinoid metabolic process
GO:0042572  retinol metabolic process
GO:0007601  visual perception

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane
GO:0042622  photoreceptor outer segment membrane

Molecular Function

GO:0009055  electron carrier activity
GO:0000166  nucleotide binding