PR domain containing 6

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同義遺伝子名

PR domain zinc finger protein 6, PRDM6, PFM3, PR domain containing 6, PR domain-containing protein 6

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:5.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:38.40 皮膚:4.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:0.09 小脳:- 脳幹:0.19 脳梁:0.34 松果体:0.51 末梢神経:- 脊柱:0.46 網膜:- 目:- 動脈:4.32 静脈:1.49 リンパ節:0.24 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:0.14 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.18 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.10 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.16 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:14.60 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:-     肝臓:10.60        肺:29.30    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:1.08 胎盤:1.64 前立腺:2.73 卵巣:1.39 精巣:0.19 心臓:0.70 骨格筋:0 食道:0.33 胃:- 腸:0.33 結腸:1.62     肝臓:0.14    肺:2.47 膀胱:2.96 腎臓:0.15 下垂体:0.52 甲状腺:0.23 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0.90 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.79 卵巣:1.21 精巣:0.76 心臓:0.23 骨格筋:0.07 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.28     肝臓:0.07        肺:1.68    膀胱:- 腎臓:0.41 下垂体:- 甲状腺:0.70 副腎:0.40 膵臓:- 乳腺:0.55 唾液腺:-

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IDs

Refseq ID NM_001136239
Gene ID 93166
Unigene ID Hs.135118
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000061455
GTEx ID ENSG00000061455

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001033281
ラット[1]  NM_001033281

染色体

5q23.2  [122,424,816  -  122,523,745]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR015880  Zinc finger, C2H2-like
IPR007087  Zinc finger, C2H2-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

20379614

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051151  negative regulation of smooth muscle cell differentiation
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0022008  neurogenesis
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0018024  histone-lysine N-methyltransferase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0042803  protein homodimerization activity