elongation factor Tu GTP binding domain containing 2

同義遺伝子名

hSNU114, U5 snRNP-specific protein, 116 kDa, EFTUD2, Snrp116, SNRP116, Elongation factor Tu GTP-binding domain protein 2, U5-116 kDa, Snu114, U5-116KD, KIAA0031

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:221.60

小脳:264.50

脳幹:-

脳梁:379.10

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:118.60

目:123.40

動脈:119.90

静脈:933.10

リンパ節:151.70

末梢血:145.70

脾臓:245.80

胸腺:399.40

骨髄:137.80

脂肪:121

骨:255.90

皮膚:139.20

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:3.46

小脳:-

脳幹:3.51

脳梁:3.67

松果体:3.46

末梢神経:-

脊柱:3.46

網膜:-

目:-

動脈:3.11

静脈:3.36

リンパ節:3.59

末梢血:-

脾臓:3.76

胸腺:4.01

骨髄:-

脂肪:3.70

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.10

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.90

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.83

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:127.60

胎盤:98.40

前立腺:56.30

卵巣:-

精巣:272.60

心臓:114.90

骨格筋:-

食道:-

胃:106.20

腸:97.20

結腸:84.80

肝臓:10.60

肺:288.40

膀胱:125.60

腎臓:62.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:203.10

膵臓:71.10

乳腺:158

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:3.51

胎盤:3.78

前立腺:3.22

卵巣:3.29

精巣:3.94

心臓:3.25

骨格筋:3.95

食道:3.58

胃:-

腸:3.57

結腸:3.32

肝臓:3.72

肺:3.13

膀胱:3.21

腎臓:3.60

下垂体:3.23

甲状腺:3.43

副腎:-

膵臓:2.98

乳腺:2.53

唾液腺:3.99

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.53

卵巣:3.79

精巣:4.15

心臓:3.31

骨格筋:4.78

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.09

肝臓:2.99

肺:2.64

膀胱:-

腎臓:3.68

下垂体:-

甲状腺:4.09

副腎:4.12

膵臓:-

乳腺:3.47

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_004247
Gene ID	9343
Unigene ID	Hs.151787
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000108883
GTEx ID	ENSG00000108883

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]	NM_001109995, NM_011431
ラット[6]	NM_001109995, NM_011431

染色体

17q21.31 [42,927,655 - 42,976,993]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR009022	Elongation factor G/III/V
IPR020568	Ribosomal protein S5 domain 2-type fold
IPR014721	Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup
IPR005225	Small GTP-binding protein
IPR000640	Translation elongation factor EFG/EF2, C-terminal
IPR005517	Translation elongation factor EFG/EF2, domain IV

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0006184	GTP catabolic process
GO:0006397	mRNA processing
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing

Cellular Component

GO:0015030	Cajal body
GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005681	spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0005525	GTP binding
GO:0003924	GTPase activity
GO:0005515	protein binding

elongation factor Tu GTP binding domain containing 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function