geranylgeranyl diphosphate synthase 1

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同義遺伝子名

GGPPS1, GGPPS, Geranylgeranyl diphosphate synthase, GGPS1, GGPPSase, Geranylgeranyl pyrophosphate synthetase, GGPP synthetase, geranylgeranyl diphosphate synthase 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:5.29 小脳:4.88 脳幹:5.36 脳梁:5.49 松果体:- 末梢神経:5.32 脊柱:5.79 網膜:- 目:- 動脈:5.22 静脈:5.20 リンパ節:4.99 末梢血:- 脾臓:5.31 胸腺:5.28 骨髄:4.59 脂肪:5.26 骨:- 皮膚:5.06
CAGE 大脳:3.58 小脳:- 脳幹:3.66 脳梁:3.44 松果体:4.08 末梢神経:- 脊柱:3.77 網膜:- 目:- 動脈:3.09 静脈:3.10 リンパ節:3.00 末梢血:- 脾臓:3.41 胸腺:3.37 骨髄:- 脂肪:3.65 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.79 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.81 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.11 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:5.41 胎盤:4.86 前立腺:6.37 卵巣:5.30 精巣:5.31 心臓:5.49 骨格筋:5.54 食道:5.07 胃:5.17 腸:5.13 結腸:4.89 肝臓:4.56 肺:4.89 膀胱:- 腎臓:5.31 下垂体:5.38 甲状腺:5.53 副腎:5.44 膵臓:4.35 乳腺:5.70 唾液腺:5.59
CAGE 子宮:3.54 胎盤:3.51 前立腺:3.76 卵巣:3.44 精巣:3.91 心臓:3.41 骨格筋:3.25 食道:3.59 胃:- 腸:3.41 結腸:3.10     肝臓:3.15    肺:3.20 膀胱:3.71 腎臓:3.60 下垂体:3.90 甲状腺:3.66 副腎:- 膵臓:2.90 乳腺:3.30 唾液腺:3.85
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.30 卵巣:3.16 精巣:3.80 心臓:2.76 骨格筋:2.40 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.62     肝臓:1.87        肺:3.25    膀胱:- 腎臓:2.53 下垂体:- 甲状腺:2.64 副腎:2.89 膵臓:- 乳腺:3.08 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001037277
Gene ID 9453
Unigene ID -
Probe set ID 202321_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000152904
GTEx ID ENSG00000152904

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_010282
ラット[1]  NM_001007626

染色体

1q42.3  [235,490,665  -  235,507,847]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8419360
9741684
10026212
10101267
10931946
12446740
12477932
15489334
16698791
16710414
16806233
17207965
17536018
17646172
18726356
20191015
21139048
21224049
21321112
21890473
21906983
22505724
23478574
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006695  cholesterol biosynthetic process
GO:0045337  farnesyl diphosphate biosynthetic process
GO:0033384  geranyl diphosphate biosynthetic process
GO:0033386  geranylgeranyl diphosphate biosynthetic process
GO:0006720  isoprenoid metabolic process

Cellular Component

GO:0005829  cytosol

Molecular Function

GO:0004161  dimethylallyltranstransferase activity
GO:0004311  farnesyltranstransferase activity
GO:0004337  geranyltranstransferase activity
GO:0046872  metal ion binding