clock homolog (mouse)

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同義遺伝子名

clock homolog (mouse), CLOCK, hCLOCK, KIAA0334, clock (mouse) homolog, Circadian locomoter output cycles protein kaput

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:7.32

小脳:7.28

脳幹:7

脳梁:6.80

松果体:-

末梢神経:7.34

脊柱:6.99

網膜:-

目:-

動脈:7.48

静脈:7.21

リンパ節:7.09

末梢血:-

脾臓:7.19

胸腺:6.10

骨髄:6.15

脂肪:7.37

骨:-

皮膚:7.08

CAGE

大脳:2.08

小脳:-

脳幹:2.10

脳梁:1.68

松果体:2.40

末梢神経:-

脊柱:2.16

網膜:-

目:-

動脈:2.15

静脈:1.44

リンパ節:1.92

末梢血:-

脾臓:2.17

胸腺:1.36

骨髄:-

脂肪:2.28

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.24

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.75

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.32

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:7.57

胎盤:7.04

前立腺:7.70

卵巣:7.52

精巣:8.07

心臓:7.43

骨格筋:6.96

食道:7.73

胃:7.46

腸:6.92

結腸:6.96

肝臓:7.41

肺:6.99

膀胱:-

腎臓:7.13

下垂体:8.24

甲状腺:7.52

副腎:7.64

膵臓:6.41

乳腺:7.38

唾液腺:7

CAGE

子宮:2.40

胎盤:2.10

前立腺:2.27

卵巣:2.36

精巣:2.72

心臓:2.17

骨格筋:2.13

食道:2.37

胃:-

腸:2.47

結腸:2.00

肝臓:2.03

肺:2.23

膀胱:1.96

腎臓:2.41

下垂体:2.75

甲状腺:2.43

副腎:-

膵臓:1.87

乳腺:1.92

唾液腺:1.75

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.79

卵巣:2.63

精巣:2.98

心臓:2.54

骨格筋:2.16

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.21

肝臓:1.26

肺:1.85

膀胱:-

腎臓:1.73

下垂体:-

甲状腺:2.87

副腎:1.66

膵臓:-

乳腺:2.19

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_004898
Gene ID	9575
Unigene ID	-
Probe set ID	204980_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000134852
GTEx ID	ENSG00000134852

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_007715
ラット[1]	NM_021856

染色体

4q12 [56,298,643 - 56,413,305]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000014

PAS

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0071479	cellular response to ionizing radiation
GO:0032922	circadian regulation of gene expression
GO:0007623	circadian rhythm
GO:0000077	DNA damage checkpoint
GO:0009648	photoperiodism
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007165	signal transduction

Cellular Component

GO:0005694	chromosome
GO:0005829	cytosol
GO:0043231	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0070888	E-box binding
GO:0004402	histone acetyltransferase activity
GO:0046983	protein dimerization activity
GO:0004871	signal transducer activity
GO:0003700	transcription factor activity

clock homolog (mouse)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function