SRY (sex determining region Y)-box 13

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同義遺伝子名

SOX13, ICA12, Islet cell antigen 12, Type 1 diabetes autoantigen ICA12, MGC117216, Sox-13, SOX-13 protein, SRY (sex determining region Y)-box 13, SRY-box 13

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:19 小脳:50.40 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:58.80 動脈:60 静脈:- リンパ節:- 末梢血:18.20 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:39.40 脂肪:- 骨:- 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:7.04 小脳:7.05 脳幹:7.10 脳梁:7.13 松果体:- 末梢神経:7.41 脊柱:7.29 網膜:- 目:- 動脈:7.29 静脈:7.22 リンパ節:6.84 末梢血:- 脾臓:6.92 胸腺:6.32 骨髄:6.80 脂肪:7.56 骨:- 皮膚:7.08
CAGE 大脳:2.82 小脳:- 脳幹:3.22 脳梁:3.36 松果体:1.71 末梢神経:- 脊柱:3.30 網膜:- 目:- 動脈:3.31 静脈:3.09 リンパ節:2.32 末梢血:- 脾臓:2.63 胸腺:0.64 骨髄:- 脂肪:3.78 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.62 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.64 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.23 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:45.60 胎盤:21.90 前立腺:22.50 卵巣:74.50 精巣:43.30 心臓:63.90 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:50.90     肝臓:10.60        肺:34.20    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:55.80 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.38 胎盤:7.34 前立腺:7.27 卵巣:7.14 精巣:6.76 心臓:7.16 骨格筋:7.07 食道:7.15 胃:7.14 腸:7.22 結腸:7.33 肝臓:7.48 肺:7.70 膀胱:- 腎臓:7.54 下垂体:7.02 甲状腺:7.11 副腎:7.33 膵臓:6.98 乳腺:7.30 唾液腺:7.01
CAGE 子宮:4.23 胎盤:3.86 前立腺:3.87 卵巣:3.30 精巣:2.78 心臓:2.74 骨格筋:3.23 食道:3.15 胃:- 腸:3.51 結腸:3.53     肝臓:2.61    肺:3.74 膀胱:3.66 腎臓:3.61 下垂体:2.57 甲状腺:2.99 副腎:- 膵臓:2.90 乳腺:3.60 唾液腺:2.46
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.45 卵巣:2.79 精巣:2.79 心臓:1.63 骨格筋:2.44 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.87     肝臓:2.16        肺:3.60    膀胱:- 腎臓:3.14 下垂体:- 甲状腺:2.45 副腎:3.04 膵臓:- 乳腺:2.90 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_005686
Gene ID 9580
Unigene ID Hs.201671
Probe set ID 209736_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000143842
GTEx ID ENSG00000143842

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_011439
ラット[1]  NM_001105952

染色体

1q32.1  [204,042,243  -  204,096,863]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910  High mobility group, HMG1/HMG2
IPR009071  High mobility group, superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9421502
10198172
10854791
10871192
11126406
11264788
11270687
11286511
11323090
12021109
12021128
12021135
12100890
12194848
12473246
12477932
14679071
15231748
19536175
20028982
21988832

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0009653  anatomical structure morphogenesis
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity