ROD1 regulator of differentiation 1 (S. pombe)

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同義遺伝子名

regulator of differentiation (in S. pombe) 1, ROD1, Rod1, Regulator of differentiation 1, ROD1 regulator of differentiation 1 (S. pombe), DKFZp781I1117

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:24.90 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:214.70 脊柱:561.50 網膜:- 目:23.50 動脈:149.90 静脈:- リンパ節:202.20 末梢血:72.90 脾臓:- 胸腺:180.40 骨髄:98.40 脂肪:40.30 骨:- 皮膚:120
GeneChip 大脳:4.60 小脳:4.89 脳幹:4.60 脳梁:4.63 松果体:- 末梢神経:4.33 脊柱:4.32 網膜:- 目:- 動脈:4.34 静脈:4.74 リンパ節:4.51 末梢血:- 脾臓:4.49 胸腺:4.91 骨髄:5 脂肪:4.58 骨:- 皮膚:4.56
CAGE 大脳:3.34 小脳:- 脳幹:3.17 脳梁:3.27 松果体:4.18 末梢神経:- 脊柱:4.01 網膜:- 目:- 動脈:4.35 静脈:4.64 リンパ節:5.04 末梢血:- 脾臓:4.56 胸腺:4.94 骨髄:- 脂肪:4.53 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:91.10 胎盤:43.70 前立腺:45.10 卵巣:37.30 精巣:77.90 心臓:12.80 骨格筋:20.10 食道:- 胃:212.40 腸:32.40 結腸:178.10     肝臓:116.10        肺:122.20    膀胱:- 腎臓:104 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:160 乳腺:120.80 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.69 胎盤:4.70 前立腺:4.29 卵巣:4.80 精巣:4.34 心臓:4.62 骨格筋:4.77 食道:4.96 胃:4.61 腸:4.75 結腸:4.69 肝臓:4.59 肺:4.61 膀胱:- 腎臓:4.66 下垂体:4.35 甲状腺:4.40 副腎:4.49 膵臓:5.09 乳腺:4.54 唾液腺:4.65
CAGE 子宮:4.32 胎盤:4.56 前立腺:4.12 卵巣:4.00 精巣:4.67 心臓:4.03 骨格筋:3.36 食道:4.99 胃:- 腸:4.78 結腸:4.76     肝臓:3.82    肺:4.86 膀胱:4.51 腎臓:4.60 下垂体:4.15 甲状腺:3.84 副腎:- 膵臓:4.23 乳腺:4.71 唾液腺:4.49
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.00 精巣:0.59 心臓:0.66 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.38        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001163790
Gene ID 9991
Unigene ID Hs.269988
Probe set ID 214698_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000119314
GTEx ID ENSG00000119314

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]  NM_144904, NM_178164
ラット[1]  NM_031346, NM_178164

染色体

9q32  [114,980,715  -  115,095,947]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10207106
12477932
14702039
15146197
15489334
18335065
19322201
19441079
19471022
20379614
20467438
21139048
21832049
21890473
21906983
21963094
21987572
22505724
22575643
22939629
23000965
23022380
23024754
24457600
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0009653  anatomical structure morphogenesis
GO:0043249  erythrocyte maturation
GO:0006397  mRNA processing
GO:0033119  negative regulation of RNA splicing
GO:0045595  regulation of cell differentiation
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0000166  nucleotide binding
GO:0003723  RNA binding