RNA binding motif protein 16

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同義遺伝子名

RNA binding motif protein 16, mKIAA1116, AI447644, AA408306, Rbm16, KIAA1116, A630086M08Rik, A930036P18Rik, AU015035, AI448652

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:62.50 小脳:73.70 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:95.50 脊柱:283.70 網膜:321.40 目:136.80 動脈:84.40 静脈:- リンパ節:32.40 末梢血:86.30 脾臓:105.30 胸腺:177.80 骨髄:- 脂肪:- 骨:62.60 皮膚:71.30
GeneChip 大脳:8.42 小脳:8.70 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.10 脊柱:8.07 網膜:8.49 目:7.85 動脈:- 静脈:8.33 リンパ節:9.38 末梢血:- 脾臓:8.99 胸腺:- 骨髄:8.91 脂肪:8.13 骨:8.63 皮膚:8.37
CAGE 大脳:4.17 小脳:- 脳幹:3.89 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:4.05 網膜:- 目:- 動脈:3.89 静脈:- リンパ節:4.45 末梢血:- 脾臓:3.92 胸腺:4.22 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.08 皮膚:4.24
RNA-seq 大脳:3.91 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:130.90 胎盤:41.40 前立腺:30.90 卵巣:160.90 精巣:29.60 心臓:- 骨格筋:71 食道:- 胃:32.70 腸:- 結腸:17.60     肝臓:9.10        肺:70.30    膀胱:- 腎臓:24.20 下垂体:12.90 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:46.90 乳腺:65.30 唾液腺:108
GeneChip 子宮:8.56 胎盤:8.97 前立腺:8.76 卵巣:8.87 精巣:7.85 心臓:8.15 骨格筋:7.94 食道:- 胃:8.20 腸:8.60 結腸:- 肝臓:7.90 肺:8.68 膀胱:8.60 腎臓:8.31 下垂体:9.21 甲状腺:- 副腎:8.42 膵臓:7.20 乳腺:8.24 唾液腺:8.03
CAGE 子宮:4.02 胎盤:3.92 前立腺:3.59 卵巣:4.04 精巣:3.11 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.13 腸:3.55 結腸:3.41     肝臓:3.50    肺:3.96 膀胱:3.88 腎臓:- 下垂体:4.24 甲状腺:- 副腎:3.74 膵臓:4.11 乳腺:3.57 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.35 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:2.68        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_134123
Gene ID 106583
Unigene ID Mm.124373
Probe set ID 1426826_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000046201

オーソログ対応遺伝子

ヒト[1]  NM_014892
ラット [0]  

染色体

17A1  [3,114,972  -  3,198,855]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006569  RNA polymerase II, large subunit, CTD
IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
12693553
12904583
14610273
15741177
15782199
16033648
16141072
16141073
17967808
18799693
22083510

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006397  mRNA processing
GO:0008380  RNA splicing
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0016363  nuclear matrix
GO:0005634  nucleus
GO:0005681  spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0019904  protein domain specific binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0070063  RNA polymerase binding
GO:0043175  RNA polymerase core enzyme binding