OTU domain, ubiquitin aldehyde binding 1

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同義遺伝子名

Otubain-1, Ubiquitin-specific-processing protease OTUB1, OTU domain, ubiquitin aldehyde binding 1, Ubiquitin thioesterase protein OTUB1, AI850305, Deubiquitinating enzyme OTUB1, Otub1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:161.50 小脳:- 脳幹:63.60 脳梁:- 松果体:257.80 末梢神経:19.10 脊柱:141.90 網膜:160.70 目:38 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:28.80 脾臓:13.20 胸腺:9.90 骨髄:12.80 脂肪:- 骨:100.20 皮膚:23.80
GeneChip 大脳:9.41 小脳:8.19 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.99 脊柱:9.33 網膜:5.48 目:5.48 動脈:- 静脈:8.70 リンパ節:8.08 末梢血:- 脾臓:7.45 胸腺:- 骨髄:7.81 脂肪:8.06 骨:7.39 皮膚:7.19
CAGE 大脳:5.39 小脳:- 脳幹:5.63 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:5.60 網膜:- 目:- 動脈:4.12 静脈:- リンパ節:4.29 末梢血:- 脾臓:4.12 胸腺:4.45 骨髄:- 脂肪:- 骨:4.29 皮膚:4.20
RNA-seq 大脳:51.11 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:43.60 胎盤:82.80 前立腺:- 卵巣:34.50 精巣:- 心臓:37.20 骨格筋:142 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:141     肝臓:36.20        肺:20.10    膀胱:66.20 腎臓:48.40 下垂体:51.70 甲状腺:224.90 副腎:- 膵臓:18.80 乳腺:55.50 唾液腺:108
GeneChip 子宮:8.17 胎盤:8.45 前立腺:8.06 卵巣:8.53 精巣:8.23 心臓:7.39 骨格筋:8.47 食道:- 胃:8.13 腸:7.79 結腸:- 肝臓:8.07 肺:7.90 膀胱:7.65 腎臓:8.28 下垂体:8.13 甲状腺:- 副腎:8.50 膵臓:7.36 乳腺:8.16 唾液腺:5.95
CAGE 子宮:4.65 胎盤:4.52 前立腺:4.34 卵巣:4.59 精巣:5.04 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:4.64 腸:4.34 結腸:4.62     肝臓:4.66    肺:4.43 膀胱:4.62 腎臓:- 下垂体:4.67 甲状腺:- 副腎:4.92 膵臓:3.86 乳腺:4.26 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:8.70 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:10.42        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_134150
Gene ID 107260
Unigene ID Mm.203921
Probe set ID 1417705_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000024767

オーソログ対応遺伝子

ヒト[3]  NM_017670
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR019400  Peptidase C65, otubain
IPR016615  Ubiquitin thioesterase Otubain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
10349636
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
14610273
14661020
15489334
15618518
15741177
15782199
16141072
16141073
18287559
18799693
18973680
22174793
22442722
24071738
24457600

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006281  DNA repair
GO:0071108  protein K48-linked deubiquitination
GO:0019538  protein metabolic process
GO:0006508  proteolysis
GO:0006974  response to DNA damage stimulus

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component
GO:0005737  cytoplasm

Molecular Function

GO:0008234  cysteine-type peptidase activity
GO:0016787  hydrolase activity
GO:0019784  NEDD8-specific protease activity
GO:0008242  omega peptidase activity
GO:0008233  peptidase activity
GO:0043130  ubiquitin binding
GO:0031625  ubiquitin protein ligase binding
GO:0004843  ubiquitin-specific protease activity