serine hydroxymethyltransferase 2 (mitochondrial)

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同義遺伝子名

AA408223, serine hydroxymethyl transferase 2 (mitochondrial), AA986903, 2700043D08Rik, Shmt2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:6.55 小脳:7.29 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:6.82 脊柱:7.07 網膜:5.50 目:5.93 動脈:- 静脈:7.61 リンパ節:8.42 末梢血:- 脾臓:8.11 胸腺:- 骨髄:8.71 脂肪:7.55 骨:7.66 皮膚:6.86
CAGE 大脳:3.31 小脳:- 脳幹:3.06 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.21 網膜:- 目:- 動脈:3.10 静脈:- リンパ節:3.65 末梢血:- 脾臓:4.67 胸腺:4.09 骨髄:- 脂肪:- 骨:3.99 皮膚:3.31
RNA-seq 大脳:5.05 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:8 胎盤:7.92 前立腺:7.23 卵巣:7.69 精巣:6.73 心臓:7.73 骨格筋:7.56 食道:- 胃:7.34 腸:7.40 結腸:- 肝臓:10.53 肺:6.96 膀胱:7.63 腎臓:9.96 下垂体:7.48 甲状腺:- 副腎:6.92 膵臓:8.55 乳腺:7.62 唾液腺:7.82
CAGE 子宮:3.79 胎盤:3.98 前立腺:3.40 卵巣:3.77 精巣:2.95 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:3.32 腸:3.92 結腸:3.55     肝臓:5.37    肺:3.01 膀胱:3.59 腎臓:- 下垂体:3.49 甲状腺:- 副腎:3.60 膵臓:4.47 乳腺:3.52 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:3.56 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:35.62        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_028230
Gene ID 108037
Unigene ID -
Probe set ID 1426423_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000025403

オーソログ対応遺伝子

ヒト[15]  NM_001166356, NM_001166357, NM_001166358, NM_001166359, NM_005412
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10349636
10725249
10922068
11042159
11076861
11217851
11544199
12466851
12477932
12865426
12904583
14610273
14651853
14681479
15782199
16141072
16141073
17309103
17937387
18614015
18799693
19513116
21267068

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006545  glycine biosynthetic process
GO:0019264  glycine biosynthetic process from serine
GO:0006544  glycine metabolic process
GO:0006564  L-serine biosynthetic process
GO:0032259  methylation
GO:0006730  one-carbon metabolic process
GO:0008284  positive regulation of cell proliferation
GO:0051289  protein homotetramerization

Cellular Component

GO:0015630  microtubule cytoskeleton
GO:0005743  mitochondrial inner membrane
GO:0005758  mitochondrial intermembrane space
GO:0005759  mitochondrial matrix
GO:0042645  mitochondrial nucleoid
GO:0005739  mitochondrion

Molecular Function

GO:0016597  amino acid binding
GO:0003682  chromatin binding
GO:0004372  glycine hydroxymethyltransferase activity
GO:0042802  identical protein binding
GO:0008732  L-allo-threonine aldolase activity
GO:0008168  methyltransferase activity
GO:0030170  pyridoxal phosphate binding
GO:0016740  transferase activity