high mobility group AT-hook I, related sequence 1

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同義遺伝子名

high mobility group AT-hook I, related sequence 1, Hmgi-rs1, Hmga1-rs1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:8.49 小脳:8.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:8.34 脊柱:9.99 網膜:8.63 目:8.39 動脈:- 静脈:7.83 リンパ節:9.63 末梢血:- 脾臓:9.67 胸腺:- 骨髄:9.92 脂肪:7.54 骨:9.36 皮膚:8.61
CAGE 大脳:0.10 小脳:- 脳幹:0.83 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:0.66 網膜:- 目:- 動脈:0.36 静脈:- リンパ節:1.82 末梢血:- 脾臓:1.27 胸腺:2.03 骨髄:- 脂肪:- 骨:1.51 皮膚:1.81
RNA-seq 大脳:19.64 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:8.39 胎盤:7.93 前立腺:7.89 卵巣:7.70 精巣:9.62 心臓:8.69 骨格筋:8.76 食道:- 胃:9.12 腸:9.63 結腸:- 肝臓:7.84 肺:8.04 膀胱:8.75 腎臓:7.62 下垂体:7.65 甲状腺:- 副腎:6.85 膵臓:8.22 乳腺:7.71 唾液腺:7.34
CAGE 子宮:0.44 胎盤:1.06 前立腺:0 卵巣:0.69 精巣:0.45 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:0.67 腸:1.60 結腸:1.11     肝臓:1.12    肺:0.44 膀胱:0.77 腎臓:- 下垂体:0.29 甲状腺:- 副腎:0.26 膵臓:0 乳腺:0.63 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:4.65 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.96        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001166476
Gene ID 111241
Unigene ID -
Probe set ID 1416184_s_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000078249

オーソログ対応遺伝子

ヒト[24]  NM_002131, NM_145899, NM_145901, NM_145902, NM_145903, NM_145905
ラット[1]  NM_139327, NM_145899, NM_145901, NM_145902, NM_145903, NM_145905

染色体

11E2  [120,624,108  -  120,625,733]
17A3.3  [27,693,565  -  27,700,619]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020478  A.T hook-like
IPR017956  AT hook, DNA-binding motif
IPR000116  High mobility group, HMG-I/HMG-Y

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1429598
1559701
3192537
10349636
11042159
11076861
11217851
11410365
11593421
12466851
12477932
14729942
15489334
16141072
16141073
17525332
17622165
18630941
19131326
19367708
21267068

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006284  base-excision repair
GO:0008285  negative regulation of cell proliferation
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0051575  5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity
GO:0003906  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase activity
GO:0019899  enzyme binding
GO:0030374  ligand-dependent nuclear receptor transcription coactivator activity
GO:0042975  peroxisome proliferator activated receptor binding
GO:0042974  retinoic acid receptor binding
GO:0046965  retinoid X receptor binding
GO:0003700  transcription factor activity
GO:0008134  transcription factor binding