choroidermia

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同義遺伝子名

REP-1, Rab escort protein 1, Rep-1, Chm, choroidermia, Choroideraemia protein homolog, Rep1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:24.30 小脳:73.70 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:114.70 脊柱:- 網膜:64.30 目:22.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:54 末梢血:143.80 脾臓:92.20 胸腺:19.80 骨髄:102.60 脂肪:- 骨:75.10 皮膚:47.50
GeneChip 大脳:8.10 小脳:7.79 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:7.68 脊柱:7.47 網膜:8.41 目:8.20 動脈:- 静脈:7.40 リンパ節:7.49 末梢血:- 脾臓:7.41 胸腺:- 骨髄:6.81 脂肪:7.06 骨:7.06 皮膚:7.45
CAGE 大脳:3.94 小脳:- 脳幹:3.69 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:3.57 網膜:- 目:- 動脈:3.29 静脈:- リンパ節:4.33 末梢血:- 脾臓:2.81 胸腺:3.02 骨髄:- 脂肪:- 骨:2.93 皮膚:3.58
RNA-seq 大脳:1.21 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:11.50 精巣:22.20 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:17.60     肝臓:-        肺:60.30    膀胱:66.20 腎臓:16.10 下垂体:64.60 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:37.50 乳腺:45.70 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.14 胎盤:7.25 前立腺:7.85 卵巣:7.21 精巣:4.99 心臓:7.01 骨格筋:7.77 食道:- 胃:6.85 腸:7.12 結腸:- 肝臓:6.93 肺:7.09 膀胱:7.25 腎臓:7.16 下垂体:7.47 甲状腺:- 副腎:7.90 膵臓:6.64 乳腺:7.25 唾液腺:7.88
CAGE 子宮:3.03 胎盤:3.18 前立腺:3.39 卵巣:3.07 精巣:0.99 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:2.26 腸:2.97 結腸:3.04     肝臓:2.87    肺:3.37 膀胱:3.25 腎臓:- 下垂体:3.59 甲状腺:- 副腎:3.11 膵臓:2.97 乳腺:3.01 唾液腺:-
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:2.33 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:3.04        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018818
Gene ID 12662
Unigene ID Mm.257316
Probe set ID 1448712_at  [Mouse430_2]
Ensembl ID ENSMUSG00000025531

オーソログ対応遺伝子

ヒト[2]  NM_000390, NM_001145414
ラット [0]  

染色体

-

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR018203  GDP dissociation inhibitor
IPR001738  Rab escort (choroideraemia) protein
IPR016664  Rab protein geranylgeranyltransferase component A, eukaryota

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9175730
10349636
10922068
11042159
11076861
11217851
12466851
12477932
12520002
12904583
14610273
15242790
15489334
15741177
15782199
16141072
16141073
16410831
19228596
20445111
21267068
23460904

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0001568  blood vessel development
GO:0006886  intracellular protein transport

Cellular Component

GO:0005968  Rab-protein geranylgeranyltransferase complex

Molecular Function

GO:0005096  GTPase activator activity
GO:0004663  Rab geranylgeranyltransferase activity
GO:0017137  Rab GTPase binding